Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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1
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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2
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14678717--14678756
20
2.0
20
100
0
80
45
10
20
25
1.81
14681787--14681836
19
2.5
20
80
6
57
60
2
2
36
1.20
14681829--14681889
8
7.0
8
79
17
68
72
1
1
24
1.03
14681829--14681937
19
6.0
18
74
14
75
66
2
5
25
1.27
14681827--14681887
26
2.4
24
75
24
70
72
1
1
24
1.03
14681808--14681934
38
3.4
38
75
10
111
63
2
4
29
1.27
14682091--14682124
17
2.1
16
88
5
50
20
5
2
70
1.21
14682080--14682151
37
1.9
37
83
5
92
29
5
2
62
1.32
14682767--14682800
10
3.2
10
91
8
50
44
0
0
55
0.99
14687101--14687129
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
14697653--14697840
40
4.7
40
93
2
290
23
21
29
25
1.99
14697649--14697861
80
2.7
80
85
7
299
24
21
27
26
1.99
14702935--14702992
26
2.2
26
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0
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17
24
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14707895--14707945
25
2.0
25
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0
84
31
17
13
37
1.89
14709499--14709672
46
3.8
45
77
12
167
25
20
31
22
1.98
14709498--14709716
94
2.3
93
79
10
223
26
19
31
22
1.98
14709642--14709769
49
2.6
49
78
3
141
24
17
31
26
1.97
14711445--14711479
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11
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0
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0
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0
57
0.99
14717960--14718173
46
4.6
46
78
8
193
28
19
29
23
1.98
14719662--14719823
40
4.1
40
82
1
182
25
29
20
24
1.99
14727674--14727841
40
4.2
39
81
5
169
25
27
22
25
2.00
14727674--14727841
80
2.1
80
84
3
214
25
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14733221--14733269
22
2.2
23
85
3
64
20
20
12
46
1.82
14738367--14738486
46
2.6
46
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5
152
21
28
21
28
1.99
14743763--14743931
48
3.6
48
79
4
200
29
18
28
23
1.98
14743766--14744081
48
6.7
49
70
14
148
28
19
27
24
1.98
14752763--14752847
27
3.2
27
63
21
70
18
31
25
23
1.97
14752753--14752880
53
2.4
53
97
0
238
17
28
28
25
1.98
14752778--14752861
27
3.1
27
64
21
68
22
28
25
23
1.99
14757953--14757990
19
2.0
19
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51
18
10
0
71
1.14
14780383--14780549
40
4.2
40
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2
185
25
27
21
25
1.99
14780383--14780549
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
14781374--14781419
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2.5
19
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22
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34
23
17
23
1.96
14783983--14784204
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1.8
122
82
3
284
31
11
23
32
1.91
14784163--14784313
40
3.8
40
75
11
123
26
24
27
21
2.00
14784200--14784329
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3.2
40
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2
145
23
23
28
24
2.00
14791825--14791974
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3.8
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12
132
26
24
26
22
2.00
14791861--14791990
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154
23
23
28
23
2.00
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1.9
93
91
0
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26
30
22
20
1.99
14805396--14805571
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12
180
27
29
22
20
1.98
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2.3
19
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0
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0
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1.57
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
14819845--14820052
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24
30
23
22
1.99
14819945--14820052
40
2.7
40
86
0
135
21
30
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14827205--14827239
18
1.9
18
88
0
52
8
11
0
80
0.92
14839234--14839404
93
1.8
93
94
0
306
27
29
21
21
1.99
14839226--14839401
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3.8
46
79
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207
28
28
21
21
1.98
14844479--14844544
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2.0
33
100
0
132
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18
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33
1.97
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0
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14853201--14853259
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4
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23
26
21
28
1.99
14864644--14864772
39
3.3
40
82
3
154
24
26
21
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410