Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  64  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17651605--17651755
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28
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1.99
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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19
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20
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232
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27
23
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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16
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17863909--17864176
40
6.7
40
89
0
367
19
19
27
33
1.96
17869340--17869405
14
5.0
13
74
5
53
21
6
1
71
1.16
17892154--17892196
19
2.2
20
87
4
61
27
18
6
46
1.75
17900184--17900854
68
9.9
68
89
0
925
26
23
23
26
2.00
17907098--17907398
47
6.3
47
94
1
449
29
31
8
31
1.87
17911219--17911351
47
2.8
47
85
7
173
24
28
17
29
1.97
17911351--17911471
47
2.6
45
81
11
138
20
28
17
33
1.95
17911225--17911466
126
1.9
126
84
5
319
22
28
17
31
1.97
17920887--17921047
55
2.9
55
85
1
198
24
35
20
19
1.96
17926560--17926601
4
10.5
4
100
0
84
50
23
0
26
1.50
17931890--17931926
5
7.8
5
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8
51
0
32
0
67
0.91
17931993--17932069
39
2.0
40
89
2
120
36
5
1
57
1.30
17931996--17932063
34
2.0
34
83
11
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36
5
1
55
1.33
17934255--17934473
118
1.9
117
91
1
359
38
12
21
28
1.89
17941041--17941206
47
3.5
46
76
8
138
21
28
21
29
1.98
17946615--17946687
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
17952717--17952879
40
4.1
40
81
5
170
25
28
21
25
1.99
17952717--17952879
80
2.1
79
82
3
193
25
28
21
25
1.99
17960838--17960985
40
3.7
40
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5
174
22
27
22
26
2.00
17962771--17963061
47
6.2
45
72
12
196
23
28
20
27
1.99
17962792--17963061
94
2.9
92
75
9
262
23
28
20
27
1.99
17963403--17963459
30
1.9
30
88
0
87
31
24
12
31
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17977025--17977072
14
3.5
14
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8
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6
10
2
81
0.95
17977049--17977085
19
1.9
20
88
5
58
8
10
2
78
1.06
17977603--17977641
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
17979245--17979286
3
14.0
3
84
0
57
59
0
4
35
1.19
17980925--17980977
23
2.3
23
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3
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52
15
0
32
1.42
17982886--17982957
20
3.7
19
83
7
83
58
5
1
34
1.30
17982953--17982994
19
2.3
19
83
4
59
54
0
2
42
1.13
17983334--17983374
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1.9
22
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26
1.56
17992163--17992248
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2.0
42
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0
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29
19
18
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4.3
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8
144
26
29
21
21
1.99
17996264--17996295
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
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23
25
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46
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2.0
31
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31
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30
1.89
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20
21
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1.98
18011312--18011483
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1.98
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26
26
2.00
18013968--18014224
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80
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23
22
26
26
2.00
18013971--18014225
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26
27
2.00
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22
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9
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42
1.78
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16
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1.56
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47
2.1
48
96
1
186
34
8
6
49
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18030579--18030727
40
3.7
40
86
0
190
24
27
22
25
2.00
18044570--18044717
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2.6
58
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7
158
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16
18
32
1.93
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32
2.5
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20
1.31
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2.4
55
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0
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1.98
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2.0
37
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0
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19
2.0
20
90
5
62
23
30
0
46
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410