Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
Entropy
(0-2)
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2
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2.6
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12
75
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5
0
67
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7130792--7131179
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2
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0
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0
0
48
1.00
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1.9
18
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54
25
11
11
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47
2.0
47
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0
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23
13
36
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1.92
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2.4
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0
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23
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1.98
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0
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25
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48
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27
17
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7162308--7162400
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20
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1.99
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2.0
29
100
0
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10
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28
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1.9
25
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20
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0
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24
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1.99
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29
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1.9
92
96
0
315
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29
28
1.98
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2
20.5
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0
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48
0
0
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2.0
26
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4
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14
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.82
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2.4
25
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0
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27
27
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25
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2
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133
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1.98
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0
0
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0
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26
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0
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13
0
54
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7235119--7235152
17
1.9
18
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5
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147
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0
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0
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21
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51
69
2
10
17
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410