Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  318  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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232
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1.96
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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19
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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5.0
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5
197
27
21
21
29
1.98
98917020--98917067
20
2.3
21
96
3
89
33
18
10
37
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25
1.9
25
86
0
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25
16
25
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23
97
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220
29
21
21
27
1.98
98925008--98925050
20
2.2
20
100
0
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32
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11
37
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3
100
0
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0
0
33
0.92
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0
28
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98937969--98938024
10
5.8
10
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0
26
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98938417--98938479
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14
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0
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20
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0
0
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3.4
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35
22
20
20
1.96
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27
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0
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1.97
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19
19
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1.95
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43
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0
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1.98
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29
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20
28
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1.97
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43
3.6
42
77
10
152
25
18
26
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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26
17
24
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1.97
98976563--98976726
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1.9
85
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26
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1.96
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11
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1.98
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173
23
29
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99059428--99059638
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29
1.99
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0
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0
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209
28
18
28
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410