Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  336  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104087602--104087631
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14
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2.6
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14
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2.3
138
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23
14
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104118169--104118482
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3.4
93
87
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424
20
23
14
41
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30
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4
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0
51
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0
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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53
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1.9
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2.0
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21
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24
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2
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16
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10
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0
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22
29
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31
35
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20
20
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1.9
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297
27
30
21
21
1.98
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18
12
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14
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20
13
1.76
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29
21
20
1.98
104172699--104172868
92
1.8
93
93
1
297
27
29
21
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
0
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22
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33
2
0
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1.06
104176227--104176404
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6.4
28
73
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101
32
2
2
63
1.19
104176310--104176397
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7
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32
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0
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1.06
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202
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26
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14
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19
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20
86
4
57
65
7
0
26
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1
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0
0
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3
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25
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0
4
42
1.20
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0
2
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23
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21
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0
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5.0
119
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20
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35
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3
273
38
11
13
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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24
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140
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0
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3
66
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.60
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100
0
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33
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7
50
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410