Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  390  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118379811--118379847
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10
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0
0
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16
16
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0
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19
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19
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2.8
26
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78
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1
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56
30
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0
47
1.51
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2.5
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3
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1.61
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3
27.7
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103
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2
35
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118427087--118427164
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3.0
26
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2
35
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16
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1.9
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93
36
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17
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1.94
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22
2.3
22
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3
66
25
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13
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1.9
40
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0
143
47
6
7
38
1.59
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22
2.0
22
86
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63
36
38
2
22
1.67
118437633--118437661
11
2.5
12
88
11
51
58
0
24
17
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
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1.90
118442984--118443150
75
2.3
73
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7
216
31
10
24
33
1.90
118446781--118446809
11
2.5
12
88
11
51
58
0
24
17
1.38
118453744--118453786
19
2.3
18
81
18
52
34
6
0
58
1.25
118455070--118455120
23
2.2
23
89
0
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5
15
60
1.54
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0
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35
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53
10
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1.70
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3.2
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28
24
23
2.00
118498185--118498348
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4.1
40
78
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145
21
28
25
25
1.99
118501576--118501612
16
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58
40
0
0
59
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10
58
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0
0
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0.96
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26
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0
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2
93
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3
0
48
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0
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0
35
0
0.98
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2.3
23
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97
38
3
9
48
1.54
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65
2
0
32
1.07
118535780--118535815
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5.8
6
96
3
63
19
0
0
80
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118537627--118537666
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19
100
0
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20
10
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47
1.79
118541573--118541659
26
3.2
26
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51
3
2
42
1.31
118548414--118548584
47
3.6
47
81
4
175
30
28
16
24
1.97
118551716--118551759
16
2.7
16
82
3
52
68
9
4
18
1.34
118552439--118552495
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2.0
29
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21
5
7
66
1.36
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0
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1.05
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28
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183
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1.94
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2.1
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3.8
12
86
13
58
71
0
6
22
1.09
Indices
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Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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5
17
34
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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30
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3
48
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410