Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  25  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6393255--6393490
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0
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2.7
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281
18
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0
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0
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3.1
137
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1.9
20
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0
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23
2
5
68
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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20
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92
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5.7
12
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13
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64
4
1
29
1.22
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33
2.1
33
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2.0
27
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1.9
35
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2.1
20
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75
19
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1.26
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2.0
27
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63
59
5
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1.21
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19
2.7
19
82
17
63
59
5
0
34
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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112
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2.1
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116
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18
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5
0
25
68
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6513040--6513242
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2
56
1.34
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17
2.0
17
100
0
68
76
5
0
17
0.98
6515400--6515446
23
2.0
23
100
0
94
44
8
17
29
1.78
6516856--6517080
44
5.1
44
72
3
157
28
21
18
31
1.97
6516856--6517080
88
2.6
88
78
2
211
28
21
18
31
1.97
6517001--6517278
130
2.1
130
85
0
367
27
22
21
28
1.99
6517069--6517274
44
4.7
44
73
10
145
28
25
18
27
1.98
6527603--6527649
23
2.0
23
100
0
94
44
8
17
29
1.78
6529621--6529756
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
6531242--6531294
26
2.0
26
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7
72
37
22
15
24
1.92
6531542--6531816
136
2.0
137
96
0
507
24
18
24
32
1.97
6534726--6534904
66
2.7
66
76
0
178
27
13
25
32
1.94
6538779--6538834
28
2.0
27
83
10
69
42
5
0
51
1.24
6538887--6538923
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
6538946--6539002
15
3.5
15
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49
3
0
47
1.18
6539324--6539395
31
2.2
34
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11
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13
0
31
1.40
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14
5.0
13
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5
57
42
13
4
40
1.63
6539413--6539479
28
2.4
28
89
0
107
40
13
4
41
1.64
6553235--6553288
2
27.5
2
89
10
85
50
0
1
48
1.11
6553473--6553500
14
2.0
14
100
0
56
57
0
0
42
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14
2.1
14
93
0
51
0
16
0
83
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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32
0
0
67
0.91
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86
2.0
86
86
0
236
36
4
10
48
1.58
6562371--6562413
21
2.0
21
95
0
77
34
25
16
23
1.95
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35
2.0
35
94
0
122
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25
5
31
1.80
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2.0
21
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0
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45
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1.79
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2.1
17
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0
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2
5
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1.24
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2.5
30
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0
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2
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1.59
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0
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20
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10
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4.0
19
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9
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6
0
37
1.25
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19
4.3
19
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0
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1.26
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2.1
18
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10
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40
5
0
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1.24
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23
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3.2
12
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7
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73
0
23
2
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2.3
20
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26
0
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2.0
55
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29
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1
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1.98
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139
1.9
140
91
0
432
25
29
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26
1.98
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18
3.6
18
78
0
74
37
10
10
40
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6605505--6605561
18
3.2
18
75
9
62
38
15
8
36
1.79
6605590--6605636
19
2.6
18
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3
58
53
8
6
31
1.57
6605750--6605868
47
2.3
52
75
20
142
44
21
16
16
1.86
6605760--6605866
47
2.3
47
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3
162
45
21
15
16
1.85
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0
0
50
1.00
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2
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0
0
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1.00
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2.0
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0
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33
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38
1.93
6620195--6620285
23
3.9
23
88
2
74
19
23
20
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410