Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  250  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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22
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Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Percent
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Score
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136
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10
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77430102--77430143
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
77430106--77430142
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
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15
3.5
15
71
17
51
49
1
1
47
1.22
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14
2.8
13
92
7
60
33
20
7
38
1.81
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2
34.0
2
96
0
127
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48
0
0
1.00
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10
90
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20
40
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33
1.78
77441166--77441238
36
2.0
36
91
0
119
19
36
19
24
1.94
77448074--77448239
36
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19
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19
1.93
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27
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34
2.0
34
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0
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59
1.39
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19
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28
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2.0
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2.0
27
92
0
90
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3
12
46
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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141
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3.1
33
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1.78
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2.0
21
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20
22
1.96
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14
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14
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1.62
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19.7
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1.61
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1.94
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2.0
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1.88
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1.70
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1.9
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1.93
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0
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0
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149
40
16
15
26
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77553930--77554077
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73
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0
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2.2
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1
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1.96
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0
36
45
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410