Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  374  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114239608--114239655
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4
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0
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25
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1.79
114239608--114239655
12
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0
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27
25
6
41
1.79
114247947--114248314
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5.0
73
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1.97
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10
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18
19
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5.8
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20
1.69
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2
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40
2
1
55
1.22
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9.7
25
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21
86
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3
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1.42
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17
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30
2
2
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1.15
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20
2.0
20
85
9
55
27
25
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
41
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0
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10
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1.85
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3.2
26
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4
25
36
1.77
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26
2.0
26
82
7
63
39
20
15
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10
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2
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2.0
159
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0
0
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2.3
24
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1.46
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22
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58
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2
30
1.42
114271309--114271342
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93
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52
0
0
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2.3
19
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1.92
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1.9
77
95
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30
18
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1.93
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339
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18
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22
25
2.00
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2.3
23
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16
36
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20
52
54
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7
33
1.47
114289654--114289709
24
2.3
24
82
14
62
55
8
5
30
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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65
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0
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2.0
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22
12
50
1.76
114293789--114293974
95
1.9
97
92
2
313
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15
26
30
1.96
114294612--114294661
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5.0
10
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2
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1.26
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1.54
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2
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57
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1.18
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5.0
83
94
0
729
26
20
20
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1.9
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0
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19
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32
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44
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16
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0
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1
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0
84
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0
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0
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23
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25
20
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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20
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2.1
137
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1.98
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1.99
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1.99
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0
35
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
21
85
9
57
19
46
21
12
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410