Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  23  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.28
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12
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0
82
8
32
59
0
1.28
6013329--6013387
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4.1
15
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1.78
6026155--6026289
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245
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5
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3.1
136
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0
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25
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41
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5
234
24
26
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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0
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24
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95
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0
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2.0
21
100
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1.89
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2.1
26
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65
40
18
1
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1.61
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18
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26
19
1.70
6092360--6092412
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2.8
19
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47
5
30
16
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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9
19
1.55
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8
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0
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1.52
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1.9
101
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18
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1.94
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2.5
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19
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21
2.2
21
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7
58
34
6
8
50
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6118999--6119335
3
112.7
3
70
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27
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3
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1.36
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27
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7
74
26
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1
62
1.35
6118999--6119216
17
12.4
17
71
15
124
26
5
4
64
1.34
6119294--6119332
13
3.1
13
88
3
53
23
0
2
74
0.94
6120746--6120774
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
6121560--6121696
43
3.2
43
81
12
140
24
17
23
34
1.96
6122181--6122314
61
2.3
58
84
6
171
40
2
3
53
1.31
6122181--6122333
61
2.6
60
79
13
147
40
1
5
52
1.35
6125966--6126080
53
2.2
53
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3
151
33
10
17
39
1.84
6125997--6126109
53
2.1
53
81
0
127
33
7
15
43
1.75
6126911--6127124
98
2.2
95
80
8
220
44
17
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29
1.78
6127397--6127467
37
1.9
37
100
0
142
43
14
8
33
1.75
6128872--6128917
22
2.2
22
85
11
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50
6
0
43
1.28
6130020--6130097
40
2.0
40
82
10
97
37
8
5
48
1.57
6133457--6133481
12
2.1
12
100
0
50
28
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1.83
6133655--6133699
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2.2
20
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15
13
15
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6133660--6133701
21
2.0
21
100
0
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14
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31
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10
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1.75
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28
2.0
29
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48
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1.70
6138488--6138556
30
2.2
32
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14
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49
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21
1.73
6139101--6139151
12
4.2
12
87
0
66
21
1
9
66
1.31
6139101--6139151
18
2.8
18
90
0
75
21
1
9
66
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6139176--6139210
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1.9
18
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0
52
22
8
11
57
1.61
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24
3.5
24
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3
82
24
8
16
50
1.72
6139168--6139253
30
2.9
29
79
10
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24
8
16
51
1.71
6139363--6139565
64
3.2
64
92
0
325
24
13
16
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15
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0
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2.6
40
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0
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21
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21
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1.86
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0
44
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0
29
1.25
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25
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128
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7
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35
1.82
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
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0
0
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1.00
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15
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67
0
1
30
1.02
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26
2.3
26
100
0
122
16
19
26
37
1.93
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16
3.2
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5
1
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1.37
6162711--6162770
16
3.8
15
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50
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1.39
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32
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1.52
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18
2.7
17
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29
4
0
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1.10
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21
2.1
22
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11
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36
0
2
60
1.09
6163432--6163525
22
4.1
24
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20
76
39
0
2
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1.10
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37
2.5
37
82
1
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41
2
3
53
1.29
6164282--6164405
19
6.3
19
64
23
53
54
0
1
43
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6164283--6164354
10
7.2
10
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14
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56
1
0
41
1.07
6164282--6164354
29
2.4
30
84
6
94
56
1
0
42
1.08
6164323--6164355
10
3.4
10
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4
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51
0
0
48
1.00
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2.0
34
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0
1
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6167907--6168029
30
4.1
30
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0
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29
27
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48
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0
0
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2.4
27
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1.27
6173399--6173464
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6173648--6173694
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2.8
18
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15
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40
0
0
59
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410