Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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1.9
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2.0
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445
30
14
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6
52
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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55
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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A
C
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(0-2)
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37
19
22
20
1.95
10332184--10332465
141
2.0
141
96
0
519
31
22
6
38
1.80
10335969--10336038
21
3.3
21
68
7
61
47
17
21
14
1.82
10335949--10336075
42
3.0
42
81
0
146
42
15
24
17
1.88
10338069--10338140
33
2.2
33
83
11
87
26
1
18
54
1.52
10338234--10338274
21
2.0
21
85
0
55
34
2
2
60
1.23
10349581--10349636
19
3.1
18
74
20
55
39
3
0
57
1.16
10350556--10350700
66
2.1
67
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3
220
35
11
4
49
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10351883--10351923
21
1.9
22
85
14
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58
14
2
24
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10356529--10356571
13
3.4
13
74
6
52
81
4
11
2
0.93
10356874--10356934
27
2.2
29
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108
3
4
24
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1.26
10356873--10356935
28
2.2
30
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11
105
3
4
23
68
1.24
10357762--10357823
30
2.1
30
90
6
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41
29
9
19
1.83
10357919--10357953
14
2.6
14
90
4
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51
5
14
28
1.65
10357580--10358016
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5.0
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70
16
291
37
18
16
27
1.92
10357932--10358333
77
5.3
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5
406
34
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17
29
1.94
10357971--10358498
72
6.8
73
76
12
450
32
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18
29
1.95
10358337--10358498
74
2.1
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3
238
31
20
19
29
1.97
10358175--10359059
164
5.3
165
88
4
1173
33
21
18
27
1.96
10358478--10358512
14
2.5
14
90
0
52
57
5
20
17
1.60
10358413--10358586
91
2.0
89
87
4
253
33
20
19
26
1.97
10358502--10358662
73
2.1
75
84
6
211
31
21
19
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10357809--10358662
403
2.1
388
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8
955
33
19
18
28
1.95
10358577--10358750
90
2.0
88
85
6
235
33
18
20
27
1.96
10358656--10358827
74
2.3
76
83
6
233
33
20
18
27
1.96
10358739--10359069
88
3.7
87
86
5
432
35
21
17
25
1.95
10359094--10359275
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2.6
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228
35
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14
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1.93
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115
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0
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0
0
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1.41
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4
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2
0.93
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2.0
21
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0
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7
9
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1.65
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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11
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0
1
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1.01
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0
2
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127
39
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14
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199
41
21
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26
2.7
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1
1
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1.13
10383284--10383370
28
3.0
28
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19
81
58
1
1
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2.0
46
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0
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19
27
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17
1.9
16
93
6
55
56
0
0
43
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10390117--10390150
18
1.9
18
88
5
52
2
8
17
70
1.25
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20
2.0
21
85
15
55
31
0
0
68
0.90
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2.3
73
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4
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5
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1.9
13
100
0
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14
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10402103--10402266
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2.3
71
100
0
328
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1.94
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258
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177
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30
4.8
29
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5
128
27
14
19
38
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410