Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  252  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
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Score
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
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Score
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1.95
Indices
Period
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A
C
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Entropy
(0-2)
77968245--77968439
72
2.7
72
84
4
250
36
23
14
25
1.93
77975638--77975740
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
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29
2.0
29
86
6
80
54
8
3
33
1.48
77982516--77982562
19
2.3
21
92
7
80
4
0
21
74
0.99
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43
3.6
41
82
7
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32
25
16
25
1.96
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25
2.1
25
96
0
95
36
9
15
38
1.80
77997571--77997617
20
2.3
20
85
0
67
12
27
21
38
1.90
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31
2.1
31
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0
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23
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1.94
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24
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24
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191
27
21
21
29
1.98
78004115--78004257
70
2.0
72
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211
27
21
20
30
1.98
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20
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25
1.9
25
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16
25
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1.95
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19
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19
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4.7
42
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2
258
29
23
17
30
1.97
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40
2.2
39
83
6
111
39
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1.83
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40
1.9
40
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0
127
37
32
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1.87
78034364--78034405
21
2.0
21
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0
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1.34
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18
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1.54
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44
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46
1.56
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16
3.9
16
72
14
54
63
3
0
33
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78040922--78040967
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2.0
23
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13
2
43
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78041109--78041274
4
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4
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171
1
56
0
42
1.07
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24
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3
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28
20
42
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1.82
78041782--78041827
24
1.9
24
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0
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34
4
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2.5
40
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27
17
16
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1.91
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20
2.0
20
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5
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1.45
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17
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0
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1.11
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22
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25
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29
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0
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0
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28
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12
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28
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21
1.98
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2.0
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0
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5.1
40
81
2
205
25
21
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78077452--78077655
80
2.5
79
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230
25
21
27
25
1.99
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29
2.6
29
95
0
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27
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14
27
1.95
78089310--78089402
29
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29
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1.96
78089320--78089400
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7
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1.99
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0
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9
0
48
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410