Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  281  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
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188
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20
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0
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2
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86942787--86942859
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3.3
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1.9
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53
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3
40
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.66
86954792--86954837
21
2.2
21
88
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67
28
2
26
43
1.66
86960233--86960262
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3
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81
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22
14
1.91
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1.97
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4.0
73
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1.97
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3.5
12
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12
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12
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1.14
86983585--86983655
9
8.5
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83
13
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32
1
1
64
1.11
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0
0
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2.8
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74
9
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18
20
28
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.10
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53
28
0
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1.09
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81
13
78
28
0
3
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1.05
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2.1
30
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2.7
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28
18
26
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87021599--87021650
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6
50
21
0
25
53
1.45
87022231--87022284
22
2.5
22
88
8
76
50
24
0
25
1.50
87022755--87022868
14
8.1
14
73
9
70
17
2
35
43
1.63
87022838--87022868
15
2.1
15
93
0
53
12
0
45
41
1.42
87022743--87022871
42
3.1
42
76
6
136
18
2
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46
1.62
87023116--87023380
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3.2
84
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31
15
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29
1.95
87023199--87023380
84
2.2
84
91
0
292
32
15
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29
1.95
87025702--87025808
50
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51
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0
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0
0
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0.91
87026643--87026672
13
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13
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36
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87026674--87026755
9
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10
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3
32
1.70
87026656--87026746
45
2.0
45
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0
128
43
18
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1.70
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21
2.1
21
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1.59
87032592--87032673
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2.5
33
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13
6
20
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2
0
29
1.02
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22
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1.69
87060359--87060490
29
4.6
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0
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1.95
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29
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24
1.95
87070598--87070783
40
4.7
40
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5
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25
22
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25
2.00
87070651--87070806
80
2.0
79
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201
26
21
26
25
1.99
87078601--87078699
40
2.5
40
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27
22
26
24
2.00
87078902--87078988
40
2.2
40
87
6
122
22
22
25
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
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2
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35
18
14
31
1.91
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19
2.5
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4
0
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1.18
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16
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24
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1.74
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13
100
0
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0
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1.28
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1.89
87099532--87099969
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1.89
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23
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1.86
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0
0
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1.95
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1.95
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28
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18
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1.97
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4.8
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21
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1.94
87125755--87125866
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2.3
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20
21
20
1.94
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5.6
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26
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22
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2.00
87129728--87129948
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2.8
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335
26
27
22
23
2.00
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1.98
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22
28
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1.99
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2.0
54
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0
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1.84
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4.0
43
73
6
130
34
25
13
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87151314--87151430
23
4.9
24
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31
20
25
22
1.98
87151314--87151463
24
6.2
25
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33
22
23
21
1.97
87154210--87154234
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0
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0
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46
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20
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28
1.99
87163648--87163817
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1.8
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93
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28
1.98
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1.97
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2.1
59
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2
153
47
7
16
29
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410