Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  43  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10911837--10911878
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83
1
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14
0.73
10938039--10938093
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3.0
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1
0
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20
47
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2.1
38
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160
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20
1.38
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3.0
30
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99
10
17
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3.8
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281
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2.0
20
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2
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0
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50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11081100--11081170
22
3.2
22
67
11
63
43
12
8
35
1.73
11086685--11086757
38
1.9
38
85
0
101
42
15
9
32
1.79
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6.8
46
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1
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24
14
39
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26
4.2
25
91
4
157
34
3
24
37
1.73
11091146--11091255
52
2.1
52
91
0
175
34
3
24
37
1.73
11092688--11092763
26
2.8
26
84
4
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35
22
11
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1.90
11092864--11092978
27
4.3
26
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7
140
17
23
22
36
1.95
11092864--11092978
54
2.1
54
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17
23
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25
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17
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11097660--11097736
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18
14
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11102332--11102404
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2.4
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0
19
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2.3
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1.98
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42
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1.98
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28
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1.91
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27
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0
0
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19
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15
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11125641--11125687
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2.3
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18
3.5
18
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10
69
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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15
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3
0
46
1.19
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35
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0
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0
8
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27
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27
1.88
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1.83
11135031--11135215
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1.83
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1.98
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1.97
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1.96
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2.1
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1.35
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0
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0
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0
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0
0
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2.4
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6
104
31
19
23
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11192829--11193034
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5.2
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23
24
25
2.00
11200792--11200996
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5.2
40
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7
202
27
22
24
25
2.00
11212401--11212452
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2.5
20
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25
23
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2
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2
88
0
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4
2
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2.1
25
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2.8
26
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50
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2.4
43
87
4
144
44
15
0
38
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410