Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  242  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
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0
139
27
31
14
27
1.95
74870654--74870786
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
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479
30
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1.84
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2.0
23
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26
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
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227
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26
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4.0
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2.4
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20.5
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2.7
217
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2
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20
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.94
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1.95
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1.93
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3.0
35
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194
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46
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74984781--74984836
19
3.0
17
76
19
58
57
1
1
39
1.20
74990357--74990397
15
2.8
15
88
3
57
39
9
19
31
1.84
74993409--74993528
64
1.9
64
86
6
172
20
25
29
25
1.99
74994579--74994624
24
1.9
24
90
0
74
39
17
19
23
1.92
74995557--74995582
12
2.2
12
100
0
52
50
15
0
34
1.45
74995961--74995987
5
5.4
5
100
0
54
81
0
0
18
0.69
74996595--74996632
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
74999040--74999185
40
3.7
40
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0
175
24
27
21
26
2.00
74999072--74999223
40
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40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
75007150--75007295
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
75007182--75007333
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
75010039--75010082
17
2.5
17
85
7
52
11
25
43
20
1.85
75010543--75010613
27
2.7
27
80
2
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40
16
8
33
1.79
75010594--75010737
27
5.3
27
83
5
157
33
18
22
26
1.96
75010610--75010737
54
2.4
55
89
2
188
31
19
24
25
1.98
75010594--75010751
81
2.0
81
87
0
226
32
17
21
27
1.96
75015019--75015090
34
2.2
33
82
2
81
23
22
20
33
1.97
75019738--75019904
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3.9
43
80
4
169
28
13
23
33
1.93
75036344--75036533
40
4.8
40
80
6
199
26
25
26
22
2.00
75036344--75036559
80
2.7
80
81
6
235
26
25
25
22
2.00
75044305--75044483
40
4.5
40
81
9
188
26
25
25
21
2.00
75044306--75044522
80
2.7
80
80
5
244
27
24
25
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75053414--75053444
16
2.0
16
93
6
55
19
12
25
41
1.87
75054190--75054393
53
3.8
53
74
4
131
37
18
22
22
1.94
75058143--75058190
25
2.0
24
83
4
60
31
25
18
25
1.98
75058229--75058285
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
75058227--75058289
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
75058342--75058493
24
6.4
24
90
5
220
28
21
21
28
1.98
75058342--75058493
70
2.1
71
92
2
252
28
21
21
28
1.98
75059724--75059751
2
14.0
2
100
0
56
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0
0
50
1.00
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40
4.2
40
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2
196
23
20
27
27
1.99
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24
1.9
25
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69
34
25
14
25
1.94
75069222--75069278
9
5.9
9
73
15
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35
8
21
35
1.84
75069220--75069282
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
75069335--75069487
24
6.4
24
90
3
220
28
20
21
28
1.98
75069335--75069487
47
3.2
47
87
5
218
28
20
21
28
1.98
75069335--75069487
71
2.1
71
95
1
270
28
20
21
28
1.98
75070820--75071146
24
13.4
24
90
2
474
27
20
21
31
1.98
75070820--75071146
49
6.7
48
89
2
474
27
20
21
31
1.98
75071203--75071255
9
5.4
9
75
16
52
37
20
7
33
1.81
75071195--75071255
20
3.0
20
90
0
104
36
19
9
34
1.85
75071195--75071251
11
5.5
11
74
16
59
35
19
10
35
1.86
75071298--75071345
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
75072509--75072570
27
2.3
27
80
5
72
22
24
17
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75072624--75072709
27
3.1
27
72
20
79
36
6
16
40
1.75
75072687--75072843
27
5.8
27
75
6
131
29
9
20
40
1.84
75072688--75072843
81
1.9
81
81
5
190
29
9
19
41
1.83
75072842--75073014
27
6.4
27
81
2
186
40
9
21
28
1.85
75072842--75072991
81
1.9
81
87
2
221
40
10
22
27
1.85
75072842--75073012
81
2.1
81
83
4
220
40
9
21
28
1.85
75075856--75076020
40
4.1
39
79
7
163
26
27
21
24
2.00
75080566--75080645
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29
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108
27
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1.95
75087062--75087242
40
4.5
39
81
8
179
27
27
19
25
1.99
75087090--75087241
80
1.9
80
84
8
202
26
26
19
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410