Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  113  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
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2.0
59
100
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54
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2
2
64
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.5
28
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115
27
14
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1.95
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27
3.0
27
84
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28
15
26
29
1.96
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26
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
33782953--33783028
21
3.5
20
68
16
53
36
26
14
22
1.92
33782938--33783024
45
1.9
45
95
0
156
37
25
13
22
1.91
33784580--33784771
40
4.8
40
89
3
273
25
27
23
23
2.00
33793415--33793584
92
1.8
92
94
0
304
28
28
21
21
1.99
33793410--33793581
46
3.7
46
79
11
208
29
27
21
22
1.99
33793412--33793600
46
4.1
46
72
20
144
28
28
21
22
1.99
33793995--33794054
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
33800971--33801140
92
1.8
92
96
0
313
28
28
21
21
1.99
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46
3.7
46
80
11
217
29
27
21
21
1.99
33800968--33801156
46
4.1
46
73
17
151
28
28
21
21
1.99
33801546--33801605
30
2.0
30
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30
25
8
36
1.85
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40
5.1
40
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4
268
26
28
22
23
1.99
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20
2.2
21
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0
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30
2.0
30
100
0
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16
37
1.91
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93
1.8
93
91
2
281
28
28
21
22
1.99
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46
3.8
46
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189
28
28
20
22
1.98
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46
3.1
45
73
22
122
28
28
20
22
1.98
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23
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21
28
1.99
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40
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5
173
23
26
21
28
1.99
33833762--33833929
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1.8
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92
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27
29
20
21
1.98
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2.0
30
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30
25
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36
1.85
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29
2.9
29
83
3
96
25
32
19
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33835687--33835723
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8
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0
56
10
24
21
43
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33835679--33835714
16
2.2
16
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0
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8
25
19
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1.77
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2
20.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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17
2.8
18
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22
50
24
18
22
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4.2
40
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26
22
25
24
2.00
33867713--33867751
19
2.1
19
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4
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30
5
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1.70
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2.6
29
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0
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1.95
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28
2.6
28
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22
20
36
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1.96
33879938--33880069
58
2.3
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131
25
17
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24
1.96
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2.6
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0
139
27
14
31
27
1.95
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29
2.6
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22
21
35
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1.96
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2.0
660
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0
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0
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1.05
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2.1
21
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0
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1.01
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1.00
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2.0
19
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0
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13
1.55
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2.4
44
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0
185
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20
15
32
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2.2
266
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17
30
1.97
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44
2.0
44
95
0
156
28
22
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33901877--33902633
312
2.4
312
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0
1289
29
23
17
30
1.97
33902361--33902559
94
2.2
91
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4
238
25
23
18
32
1.97
33902495--33902585
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2.1
44
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0
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27
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1.95
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0
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0
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0
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27
1.99
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24
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1.99
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33917580--33917786
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254
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22
27
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2.00
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20
4.3
20
91
0
138
32
12
21
33
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410