Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  353  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109023538--109023717
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3.2
56
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4
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17
28
25
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1.9
19
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2.0
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0
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0
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1.42
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80
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0
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109032364--109032503
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23
20
1.96
109039318--109039476
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3.0
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20
1.96
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26
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4.2
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92
0
180
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1.83
109041072--109041179
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52
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1.9
130
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336
29
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23
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1.97
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21
0
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3
100
0
56
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0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
11
0
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1.33
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2.7
29
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1
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2.0
46
100
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41
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20
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15
11
0
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2.0
119
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105
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0
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22
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1.91
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33
20
14
31
1.93
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29
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1.40
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2.2
20
82
0
50
39
13
0
46
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109097831--109098007
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0
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0
0
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2.1
136
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0
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18
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31
1.98
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4.2
26
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0
184
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24
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1.79
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136
2.1
136
96
0
527
25
18
24
31
1.98
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14
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0
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1.06
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92
2
121
60
0
9
30
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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242
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26
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142
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2
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40
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
133
25
7
26
40
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410