Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  352  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108730109--108730162
10
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11
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17
58
55
18
0
25
1.43
108730109--108730162
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2.5
22
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6
74
55
18
0
25
1.43
108731728--108731828
44
2.2
44
94
3
175
36
23
17
21
1.95
108733378--108733432
25
2.2
25
83
6
67
65
9
9
16
1.46
108734496--108734536
19
2.2
19
86
8
57
9
7
17
65
1.44
108738543--108738568
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0
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2.3
20
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0
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108740266--108740326
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2.2
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2.0
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2.0
18
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5
54
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5
2
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51
1.41
108744036--108744152
62
1.9
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5
144
43
3
3
49
1.36
108754117--108754284
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2.4
71
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30
19
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108755650--108755706
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2.3
25
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2.0
36
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0
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36
15
32
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1.88
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37
3.9
35
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4
136
41
17
15
25
1.88
108769514--108769642
35
3.6
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7
158
41
17
14
26
1.88
108771982--108772109
36
3.5
36
81
7
152
39
31
14
14
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108772171--108772196
2
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2
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0
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50
0
0
50
1.00
108779320--108779629
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7.0
46
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15
23
22
1.92
108779377--108779451
37
2.0
37
94
2
132
29
18
28
24
1.98
108779890--108779936
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
108782871--108782901
16
1.9
16
93
0
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6
19
32
1.77
108783202--108783228
7
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100
0
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44
0
11
44
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100
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0
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48
0
0
51
1.00
108795509--108795567
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3.4
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22
56
42
1
27
28
1.65
108795505--108795571
33
2.0
33
100
0
134
40
2
23
32
1.70
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18
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13
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2
34
1.27
108797255--108797330
18
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17
65
63
3
0
32
1.13
108797232--108797331
36
2.7
37
80
9
98
62
4
2
32
1.25
108797254--108797323
19
3.9
17
78
19
63
61
2
0
35
1.11
108797259--108797323
17
3.5
18
77
16
62
58
3
0
38
1.14
108797259--108797331
19
3.9
18
68
17
51
61
4
0
34
1.15
108797579--108797617
20
2.0
20
84
0
51
33
7
0
58
1.26
108801213--108801275
31
2.0
31
100
0
126
49
6
0
44
1.28
108801905--108801929
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3.6
7
100
0
50
16
0
0
84
0.63
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23
2.6
23
89
0
102
28
35
25
11
1.91
108815052--108815097
23
2.1
21
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56
69
0
6
23
1.11
108818296--108818320
12
2.1
12
100
0
50
68
0
0
32
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108828606--108828649
23
2.0
21
82
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52
22
9
11
56
1.62
108829620--108829659
19
2.2
19
86
8
57
22
22
0
55
1.44
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100
0
52
0
0
30
69
0.89
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20
2.4
21
83
12
68
28
6
10
56
1.56
108839347--108839390
18
2.4
18
96
0
79
25
0
9
65
1.21
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2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
108846928--108846983
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2.1
27
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30
1
1
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1.12
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16
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50
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0
0
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51
37
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0
134
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0
0
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29
2
6
61
1.35
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5
61
1.35
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5
60
1.38
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2.3
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57
1.36
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25
6.6
25
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30
4
4
60
1.37
108865393--108865565
24
7.0
25
72
14
119
29
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4
61
1.36
108865853--108865907
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24
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17
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15
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1.85
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21
27
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15.5
45
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31
20
21
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108872501--108872832
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6.9
50
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12
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33
19
20
26
1.97
108872273--108872730
96
4.9
96
74
6
350
32
18
20
28
1.96
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140
2.5
140
91
0
541
31
20
21
26
1.98
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96
1.9
95
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5
231
31
20
21
25
1.98
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20
2.0
20
100
0
78
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28
0
10
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22
2.0
21
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21
9
4
64
1.42
108874229--108874348
53
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6
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1.37
108874245--108874346
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1
5
64
1.27
108874229--108874318
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2
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1.30
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26
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1.45
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25
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25
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2
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1.22
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24
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39
2.0
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2
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20
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29
22
1.99
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4.5
40
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5
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24
14
26
1.95
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2.3
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81
6
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24
14
27
1.95
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4
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28
26
16
28
1.97
108893214--108893288
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1.9
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5
116
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2
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1.56
108896734--108896762
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2.1
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100
0
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20
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1.92
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14
1.9
14
100
0
54
59
0
0
40
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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24
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0
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1.67
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23
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0
0
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1.00
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0
0
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0
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25
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0
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1.9
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1.96
108930099--108930260
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209
27
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1.96
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1
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1.99
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43
1.43
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19
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0
55
24
2
7
65
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108994025--108994063
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0
0
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0
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0
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0
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1.95
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29
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1.96
109023544--109023699
54
2.8
55
85
4
217
30
16
28
25
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410