Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  65  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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26
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26
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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20
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2.0
51
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1.90
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3.5
29
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118
29
27
13
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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2.0
20
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29
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21
1.98
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28
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21
1.98
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1.95
18268017--18268180
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2.3
71
100
0
328
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17
35
1.94
18268017--18268214
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2.8
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3
276
20
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17
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1.95
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1.00
Indices
Period
Size
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Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
18296789--18296826
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
18297543--18297582
3
13.3
3
100
0
80
32
0
35
32
1.58
18300240--18300268
10
3.0
10
95
5
51
0
6
0
93
0.36
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45
3.6
45
77
9
156
27
19
29
23
1.98
18303872--18303987
45
2.5
45
88
4
160
31
17
26
25
1.97
18309841--18309918
24
3.5
22
79
13
88
10
19
24
46
1.81
18309841--18309938
20
4.5
22
75
16
80
11
17
24
46
1.80
18309841--18309938
44
2.2
44
87
3
144
11
17
24
46
1.80
18311146--18311181
14
2.5
15
86
4
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58
8
13
19
1.61
18312157--18312181
13
1.9
13
100
0
50
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0
12
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1.40
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7
5.3
7
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0
56
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0
51
16
1.45
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24
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24
95
0
255
19
17
26
36
1.94
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48
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48
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1
256
21
17
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1.95
18318273--18318453
72
2.5
72
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3
231
21
17
25
35
1.95
18326070--18326226
24
6.6
24
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2
255
21
17
24
36
1.95
18326070--18326226
47
3.3
48
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2
255
21
17
24
36
1.95
18326070--18326226
71
2.2
71
93
2
262
21
17
24
36
1.95
18333693--18333940
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79
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7
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25
25
21
27
1.99
18333718--18333934
119
1.8
120
82
8
282
25
24
21
27
1.99
18333716--18333940
40
5.6
39
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4
256
25
25
21
26
2.00
18336102--18336262
29
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29
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1
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25
16
32
26
1.96
18339704--18339787
29
2.9
29
92
0
141
27
30
14
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18341107--18341136
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15
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0
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0
16
0
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0.65
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29
5.6
29
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1
207
25
16
32
26
1.96
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39
4.2
39
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0
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22
20
33
23
1.97
18355075--18355268
39
4.9
39
89
0
253
22
21
32
23
1.98
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39
4.2
39
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0
263
22
20
33
23
1.97
18362994--18363187
39
4.9
39
89
0
253
22
21
32
23
1.98
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15
2.0
15
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0
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20
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50
2.3
50
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16
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1.97
18366206--18366279
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24
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32
13
25
28
1.94
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29
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26
27
1.97
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2.1
33
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16
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21
1
21
1.54
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0
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0
0
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1.93
18372010--18372173
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1.93
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0
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19
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3.2
40
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26
24
23
2.00
18380229--18380380
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23
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24
26
2.00
18382596--18382637
22
1.9
22
85
9
59
33
21
2
42
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18388222--18388432
56
3.8
56
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0
332
31
22
16
28
1.96
18389367--18389393
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1.9
14
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0
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0
0
18
0.69
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45
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0
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17
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0
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1.98
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1.98
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18426619--18426684
21
3.2
21
65
4
53
25
22
21
30
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410