Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  91  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26615835--26615905
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215
21
21
27
29
1.99
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92
1.8
92
96
0
313
21
21
28
28
1.99
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6
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153
48
15
18
17
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.81
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4.6
37
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151
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17
1.83
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19
16
1.83
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2.0
26
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2.3
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19.3
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1.85
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80
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30
9
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2.0
32
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12
37
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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57
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9
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26759623--26759672
20
2.5
21
84
9
61
56
26
6
12
1.58
26760372--26760504
37
3.4
38
79
7
124
34
23
17
24
1.96
26760368--26760464
40
2.5
38
81
5
115
30
25
19
23
1.98
26763442--26763498
29
2.0
29
100
0
114
59
3
21
15
1.51
26773700--26773796
39
2.5
39
89
0
140
37
21
25
15
1.93
26773752--26773840
46
1.9
46
93
0
151
40
23
21
14
1.90
26780888--26780923
18
1.9
19
88
5
56
33
0
0
66
0.92
26780892--26780936
19
2.3
19
84
3
54
37
0
0
62
0.96
26783207--26783253
21
2.2
21
84
0
58
21
29
25
23
1.99
26783356--26783601
119
2.1
120
90
3
390
28
21
16
33
1.95
26784177--26784266
37
2.4
38
81
1
101
18
13
37
30
1.89
26790411--26790573
82
2.0
82
81
2
193
26
14
24
33
1.94
26794707--26794751
23
2.0
23
100
0
90
13
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60
1.58
26800784--26800817
18
1.9
18
88
5
52
29
17
11
41
1.85
26802672--26802941
47
5.7
47
75
11
187
26
20
30
22
1.98
26804909--26804953
20
2.3
19
81
7
54
24
35
13
26
1.92
26815502--26815562
11
5.8
10
75
9
50
26
18
4
50
1.66
26815517--26815563
21
2.2
22
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21
17
6
55
1.64
26815517--26815565
22
2.3
21
86
10
64
20
16
8
55
1.66
26817358--26817400
18
2.4
18
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0
50
20
23
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46
1.79
26817929--26817959
9
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9
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0
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35
0
0
64
0.94
26821055--26821658
126
5.0
115
81
11
667
28
18
15
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26820993--26821655
249
2.7
245
89
4
959
28
18
15
37
1.91
26821173--26821665
126
3.9
126
89
2
726
27
17
15
38
1.90
26821693--26822664
158
6.1
158
88
2
1421
43
20
1
34
1.63
26821962--26822026
23
2.7
23
76
9
67
53
27
0
18
1.44
26822261--26822318
24
2.5
22
80
11
62
50
29
3
17
1.62
26822423--26822465
16
2.8
16
83
13
54
53
25
0
20
1.46
26821686--26822651
315
3.0
309
89
2
1247
43
20
1
33
1.63
26821693--26822664
473
2.0
468
88
3
1351
43
20
1
34
1.63
26822585--26822618
8
4.2
8
85
14
52
52
35
0
11
1.38
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41
2.0
41
100
0
168
34
22
7
35
1.82
26833561--26833622
3
20.7
3
100
0
124
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0
0
32
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2.4
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5
50
55
2
0
41
1.15
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26
2.7
26
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4
110
32
5
16
45
1.70
26836803--26836849
19
2.4
19
82
10
51
53
2
4
40
1.32
26845559--26845618
29
2.0
31
84
15
81
30
6
6
56
1.51
26847152--26847249
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2.2
45
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8
139
45
17
8
28
1.77
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48
2.7
50
75
14
120
22
23
20
32
1.98
26851931--26852190
46
5.5
47
74
11
167
23
24
19
33
1.97
26851975--26852190
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2.3
94
83
4
247
23
24
19
32
1.98
26858945--26858993
23
2.1
23
81
7
55
12
8
6
73
1.24
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21
2.5
19
78
9
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34
8
0
58
1.28
26859367--26859396
6
5.0
6
91
0
51
63
0
3
33
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26860043--26860086
2
22.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
26874076--26874184
41
2.7
41
88
0
155
17
17
28
36
1.93
26874171--26874259
38
2.3
38
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92
22
19
24
33
1.97
26876165--26876430
47
5.7
46
78
13
212
28
18
29
23
1.98
26876218--26876430
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4.5
48
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11
212
28
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23
1.97
26876165--26876430
140
1.9
141
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344
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18
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1.98
26877276--26877363
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42
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0
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102
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51
3
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1.62
26883876--26883937
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2.0
31
82
17
76
50
3
0
46
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410