Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  11  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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33
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14
28
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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17
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2884935--2885045
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18
1.95
2884935--2885045
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23
18
1.95
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28
2.7
28
95
0
134
32
9
19
38
1.84
2886677--2886786
26
4.2
26
95
0
175
36
23
5
34
1.78
2887119--2887172
15
3.6
15
78
9
65
55
11
0
33
1.35
2887964--2887992
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
2888128--2888164
15
2.4
16
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13
51
54
0
0
45
1.00
2888282--2888326
20
2.4
18
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20
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4
2
48
1.35
2893673--2893713
18
2.3
18
84
12
50
14
14
2
68
1.32
2893759--2893816
25
2.3
24
80
13
64
31
3
6
58
1.41
2893834--2893871
19
2.1
19
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5
51
28
0
7
63
1.23
2896249--2896295
23
2.0
23
91
0
76
19
23
14
42
1.88
2897602--2897660
22
2.7
22
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5
75
35
28
16
18
1.93
2901242--2901285
5
8.8
5
85
9
63
4
18
0
77
0.94
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36
1.9
36
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0
120
14
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27
1.91
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24
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0
0
61
0.96
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22
2.3
23
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13
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1.41
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11
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11
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9
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7
69
1.37
2916816--2916912
47
2.1
47
100
0
194
34
25
5
35
1.78
2916820--2916924
47
2.2
47
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3
167
35
24
4
35
1.77
2928757--2928799
3
15.0
3
88
9
63
32
0
30
37
1.58
2929610--2929660
25
2.1
25
85
3
68
49
0
1
49
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2934400--2934450
15
3.5
15
74
15
61
35
5
0
58
1.22
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29
2.1
29
83
11
76
54
6
9
29
1.57
2935355--2935398
17
2.4
18
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17
56
63
2
6
27
1.31
2935499--2935551
10
5.7
9
78
14
54
26
1
0
71
0.96
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2.9
11
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4
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0
0
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15
2.0
15
100
0
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13
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1.83
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29
1.9
29
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0
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5
50
1.35
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15
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0
6
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1.03
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7
1.01
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18
2.9
18
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1
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1.00
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19
3.1
19
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2
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79
1
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6
1.00
2942159--2942232
28
2.6
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14
77
77
1
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10
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2.1
44
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20
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18
2.4
18
100
0
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40
1.74
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2.0
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1.64
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53
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4.6
46
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29
18
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2.5
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17
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43
0
0
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39
2.5
39
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0
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38
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16
2.1
18
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10
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14
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74
2.0
75
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1
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22
20
23
1.97
2975356--2975504
76
2.0
76
91
0
244
32
14
17
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2976280--2976323
19
2.4
19
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65
59
0
13
27
1.35
2976379--2976455
38
2.0
38
100
0
154
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5
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1.73
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16
2.0
16
100
0
64
18
25
12
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1.85
2989509--2989557
25
1.9
26
84
12
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46
2
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1.45
2994955--2995001
24
1.9
25
82
4
60
63
12
2
21
1.39
2995290--2995471
91
2.0
91
100
0
364
37
17
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2.4
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4
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2
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2
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0
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0
0
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25
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1.78
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43
2.6
44
80
6
135
25
14
22
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410