Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  212  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64765736--64765853
19
5.1
22
70
19
89
34
1
0
62
1.11
64765742--64765867
47
2.7
46
80
14
143
35
1
1
61
1.15
64765792--64765865
23
3.2
22
72
11
67
35
1
1
62
1.12
64766028--64766179
26
5.8
25
71
11
81
21
5
7
65
1.39
64773389--64773498
39
2.8
38
77
10
123
30
25
21
22
1.99
64776543--64776746
80
2.5
80
80
3
239
25
22
28
24
1.99
64776543--64776723
40
4.5
40
86
1
211
27
23
28
21
1.99
64778464--64778573
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
64787571--64787658
28
3.1
29
79
10
94
35
21
22
20
1.96
64787764--64787828
28
2.3
28
97
0
121
30
7
27
33
1.85
64793345--64793369
9
2.8
9
100
0
50
24
0
8
68
1.16
64793474--64793545
33
2.2
32
88
11
103
40
0
6
52
1.28
64794244--64794295
11
4.5
11
81
11
50
57
0
13
28
1.36
64794249--64794289
12
3.5
11
90
6
55
56
0
17
26
1.41
64795885--64796014
40
3.2
40
77
13
142
24
26
24
23
2.00
64795901--64796052
40
3.8
40
80
5
146
22
26
24
26
2.00
64798490--64798699
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
64804381--64804518
40
3.5
40
94
3
226
23
28
23
23
1.99
64810246--64810293
25
1.9
25
83
8
62
33
22
12
31
1.91
64811133--64811226
39
2.4
38
85
5
127
35
40
11
12
1.80
64814865--64814953
39
2.3
38
86
5
117
35
38
12
13
1.82
64817072--64817159
28
3.1
29
79
10
94
35
21
22
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64817265--64817329
28
2.3
28
97
0
121
30
7
27
33
1.85
64822847--64822871
9
2.8
9
100
0
50
24
0
8
68
1.16
64822976--64823047
33
2.2
32
88
11
103
40
0
6
52
1.28
64823746--64823797
11
4.5
11
81
11
50
57
0
13
28
1.36
64823751--64823791
12
3.5
11
90
6
55
56
0
17
26
1.41
64825387--64825516
40
3.2
40
77
13
142
24
26
24
23
2.00
64825403--64825554
40
3.8
40
80
5
146
22
26
24
26
2.00
64827992--64828201
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
64836126--64836335
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
64838415--64838624
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
64854019--64854228
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
64860878--64861122
49
4.9
49
79
3
265
25
18
26
29
1.98
64863353--64863468
28
4.2
28
85
2
155
37
20
24
18
1.94
64864725--64864760
15
2.3
15
95
4
63
69
0
19
11
1.18
64868937--64869020
26
3.3
26
80
8
95
26
25
20
28
1.99
64869070--64869164
20
4.8
20
93
5
142
33
18
9
37
1.84
64869070--64869145
11
7.5
11
69
16
65
31
19
10
38
1.86
64869087--64869163
9
7.8
10
72
16
63
33
19
9
37
1.83
64874649--64874730
29
2.8
29
96
0
146
24
31
14
29
1.95
64875872--64876006
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
64875818--64876007
58
3.3
58
77
4
179
24
33
16
26
1.96
64883840--64883941
29
3.5
29
90
0
150
23
33
15
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64885085--64885219
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
64885089--64885220
58
2.3
58
83
0
174
23
31
15
29
1.96
64890828--64890911
26
3.4
25
82
8
100
25
22
21
30
1.98
64890828--64890911
25
3.4
25
82
11
102
25
22
21
30
1.98
64890960--64891014
11
5.5
11
71
20
57
32
20
10
36
1.87
64890960--64891033
20
3.8
20
91
8
111
35
18
9
36
1.84
64890976--64891032
9
5.8
10
76
15
57
35
19
8
36
1.83
64893406--64893432
13
2.1
13
100
0
54
29
22
7
40
1.81
64899697--64899748
25
2.1
25
100
0
104
38
7
25
28
1.83
64908039--64908259
40
5.6
41
79
9
237
25
23
27
24
2.00
64909847--64909874
6
4.7
6
100
0
56
46
0
0
53
1.00
64910095--64910169
38
2.0
38
100
0
150
45
16
18
20
1.86
64911329--64911369
19
2.2
19
95
0
73
63
2
0
34
1.08
64911431--64911491
21
2.9
21
85
4
70
29
8
1
60
1.35
64917312--64917383
29
2.5
28
88
6
101
27
26
13
31
1.94
64930504--64930544
18
2.3
18
86
0
55
19
2
36
41
1.65
64932942--64933013
33
2.2
32
88
11
103
40
0
6
52
1.28
64933697--64933748
11
4.5
11
81
11
50
57
0
13
28
1.36
64933702--64933742
12
3.5
11
90
6
55
56
0
17
26
1.41
64940047--64940082
17
2.1
18
89
5
56
19
47
22
11
1.80
64945848--64945895
25
1.9
25
83
8
62
33
22
12
31
1.91
64946734--64946827
39
2.4
38
85
5
127
35
40
11
12
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64948966--64949028
28
2.2
29
94
2
110
28
22
23
25
1.99
64949134--64949198
28
2.3
28
97
0
121
30
7
27
33
1.85
64951545--64951754
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
64958331--64958549
40
5.5
40
93
2
372
22
22
27
26
1.99
64958331--64958549
79
2.8
80
92
3
372
22
22
27
26
1.99
64965142--64965360
40
5.5
40
95
2
381
22
23
27
26
2.00
64965142--64965360
79
2.8
80
94
3
381
22
23
27
26
2.00
64973610--64973867
40
6.5
40
94
3
434
22
22
27
27
1.99
64973613--64973867
79
3.2
79
91
4
417
22
22
27
27
1.99
64973610--64973867
119
2.2
119
92
3
432
22
22
27
27
1.99
64976679--64976808
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
64984639--64984768
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
64987795--64987839
19
2.3
19
82
14
56
51
4
17
26
1.65
64989684--64989716
12
2.8
12
100
0
66
36
24
33
6
1.80
64989844--64989894
21
2.4
21
80
6
59
29
3
21
45
1.70
64990551--64990602
21
2.5
21
83
0
59
40
19
28
11
1.86
64993686--64993736
7
7.4
7
85
10
61
31
15
1
50
1.55
64993686--64993736
14
3.7
14
86
2
68
31
15
1
50
1.55
64993657--64993736
21
3.8
21
83
6
92
31
16
2
50
1.58
64993697--64993743
21
2.2
21
84
0
58
29
23
2
44
1.65
64996186--64996234
18
2.6
20
81
12
59
63
4
2
30
1.24
65000229--65000413
40
4.7
40
79
10
175
25
22
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65003278--65003403
35
3.6
35
74
8
130
40
19
8
30
1.82
65003588--65003665
41
1.9
41
84
5
104
30
33
16
19
1.94
65006168--65006298
29
4.5
29
88
0
163
29
15
31
23
1.95
65019889--65020048
29
5.5
30
88
8
222
33
13
25
27
1.94
65019889--65020048
59
2.8
57
89
4
223
33
13
25
27
1.94
65027698--65027857
29
5.5
30
88
8
222
33
13
25
27
1.94
65027698--65027857
59
2.8
57
89
4
223
33
13
25
27
1.94
65029638--65029686
23
2.1
23
100
0
98
57
4
12
26
1.53
65031401--65031453
24
2.2
25
86
3
72
33
3
7
54
1.46
65031420--65031465
24
1.9
24
86
8
67
39
6
8
45
1.61
65035067--65035129
24
2.6
24
87
0
81
36
4
9
49
1.57
65037143--65037182
2
20.0
2
94
0
71
50
2
0
47
1.14
65041825--65041864
12
3.4
12
79
6
55
70
0
12
17
1.18
65041837--65041879
12
3.6
12
78
12
52
72
2
9
16
1.21
65041825--65041876
24
2.2
24
93
3
88
69
1
11
17
1.27
65041894--65041927
18
1.9
18
94
5
61
61
2
11
23
1.43
65050456--65050647
39
4.9
39
92
0
303
24
20
31
23
1.98
65050502--65050716
79
2.7
79
80
6
188
24
21
30
23
1.99
65058870--65058912
16
2.8
15
75
6
50
39
18
0
41
1.51
65061491--65061540
20
2.4
21
83
6
57
32
0
0
68
0.90
65069982--65070108
42
3.0
43
74
13
120
29
27
18
25
1.98
65090297--65090394
28
3.4
28
84
6
108
53
0
8
38
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65092436--65092478
21
2.0
21
90
0
68
32
9
23
34
1.87
65093688--65093723
18
2.0
18
94
0
63
25
27
8
38
1.84
65098294--65098332
18
2.2
19
90
9
64
10
28
51
10
1.68
65100643--65100671
14
2.1
14
100
0
58
17
27
20
34
1.95
65106593--65106745
39
3.9
39
90
0
225
24
30
20
24
1.99
65106574--65106744
78
2.2
79
91
1
272
23
29
21
25
1.99
65109354--65109688
47
7.1
47
93
0
571
24
28
11
34
1.91
65109402--65109481
24
3.4
25
63
23
64
23
28
12
35
1.91
65113204--65113258
25
2.2
25
90
6
85
27
30
12
29
1.93
65113389--65113519
43
3.0
43
82
0
172
35
30
21
12
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410