Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  404  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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23
4
31
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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23
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0
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1
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96
0
317
27
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
1.98
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28
29
20
22
1.98
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2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
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2.2
34
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102
45
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0
53
1.08
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3
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2.3
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2
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19
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1.23
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5.2
19
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1
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50
1.27
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10
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3.4
22
68
10
73
56
2
17
23
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122073672--122073764
45
2.1
45
100
0
186
55
2
15
26
1.51
122076713--122076755
21
2.0
23
86
9
63
32
23
0
44
1.54
122078898--122078923
6
4.3
6
100
0
52
84
0
0
15
0.62
122079552--122079590
13
2.7
15
88
11
55
15
7
15
61
1.55
122079830--122079930
30
3.4
29
83
4
112
46
3
19
29
1.68
122079927--122079972
24
1.9
24
95
0
83
28
0
0
71
0.86
122080162--122080444
78
3.7
76
77
7
272
36
17
15
30
1.91
122080126--122080444
78
4.2
77
76
9
242
37
17
16
28
1.92
122080363--122080761
87
4.6
88
83
6
492
37
19
15
28
1.92
122080284--122080763
172
2.8
174
83
7
544
37
18
15
28
1.91
122080687--122080716
14
2.1
14
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0
51
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3
6
23
1.30
122080282--122080772
259
1.9
254
85
5
684
37
18
15
28
1.92
122089146--122089177
4
8.0
4
92
0
55
46
0
28
25
1.53
122092510--122092548
11
3.7
10
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10
51
43
0
2
53
1.14
122095362--122095403
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
122095403--122095445
2
21.5
2
90
0
68
4
0
44
51
1.22
122095401--122095445
18
2.5
18
100
0
90
6
0
42
51
1.28
122109246--122109284
11
3.7
10
86
10
51
43
0
2
53
1.14
122109243--122109291
21
2.3
21
79
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42
0
2
55
1.11
122112048--122112076
13
2.2
13
100
0
58
55
13
0
31
1.39
122112041--122112093
19
2.8
18
77
11
61
56
11
0
32
1.35
122112348--122112387
21
1.9
21
84
0
53
70
0
5
25
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122112626--122112727
18
5.7
18
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16
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64
4
2
27
1.28
122115570--122115601
15
2.1
15
100
0
64
37
34
12
15
1.85
122116506--122116620
29
4.1
28
67
21
71
43
3
4
48
1.39
122125242--122125270
3
9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
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15
2.1
15
93
0
53
38
0
6
54
1.26
122127305--122127359
19
2.8
20
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5
60
25
3
1
69
1.15
122129697--122129741
6
7.3
6
85
5
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37
0
0
62
0.96
122131220--122131267
16
3.1
15
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69
64
2
2
31
1.16
122131216--122131267
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
122131215--122131271
24
2.4
24
79
5
71
64
1
3
29
1.20
122131398--122131483
25
3.7
24
79
10
81
55
5
6
31
1.50
122131505--122131637
25
5.6
25
71
13
93
58
2
3
35
1.28
122131498--122131632
52
2.8
46
74
18
114
60
2
3
34
1.27
122131566--122131637
22
3.2
22
74
16
60
58
2
2
36
1.27
122132118--122132232
30
3.8
30
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0
176
22
2
48
26
1.63
122132118--122132232
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1.9
60
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0
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22
2
48
26
1.63
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14
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4
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20
1.43
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22
16
28
1.95
122133009--122133458
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6.0
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559
33
21
16
28
1.95
122133382--122133547
90
1.9
89
86
6
237
35
19
16
28
1.93
122133471--122133694
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3.0
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88
1
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32
20
17
28
1.96
122133702--122133729
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122133552--122133860
166
1.9
165
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2
467
32
21
17
28
1.96
122133717--122133953
73
3.2
73
83
3
285
34
21
16
27
1.95
122133711--122133934
74
3.0
73
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1
286
33
21
17
28
1.96
122133940--122133967
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
122133241--122134173
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3.9
238
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0
1681
33
21
17
27
1.95
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4.3
72
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5
355
34
21
16
27
1.95
122133241--122134173
478
2.0
476
95
0
1695
33
21
17
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1.95
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3.0
12
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0
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41
5
25
27
1.77
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3.1
15
90
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69
64
2
2
31
1.16
122144088--122144139
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410