Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  141  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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11
34
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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30
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30
1.85
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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4.0
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30
1.85
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82
5
107
40
17
8
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
42992578--42992710
55
2.4
54
77
6
142
37
18
9
34
1.83
42992784--42993409
27
23.3
27
86
1
801
36
19
19
24
1.95
42993626--42993677
27
2.0
26
88
3
77
17
25
21
36
1.94
42993607--42993760
67
2.3
67
97
0
290
18
28
22
31
1.97
42993693--42993743
27
1.9
26
88
4
75
19
25
17
37
1.94
42993863--42993944
6
13.3
6
73
19
71
18
17
15
48
1.81
42993863--42993935
31
2.4
31
90
0
110
17
17
15
49
1.80
42997825--42997880
15
3.7
15
79
15
71
10
14
12
62
1.55
43000014--43000200
49
3.8
50
85
7
229
24
17
28
28
1.97
43000083--43000160
23
3.3
23
67
22
70
25
16
28
29
1.97
43005797--43005845
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
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40
4.2
40
80
6
178
25
21
28
25
1.99
43006668--43006834
80
2.1
79
84
7
214
25
21
28
25
1.99
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5
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5
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57
81
0
0
18
0.70
43013975--43014005
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
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27
4.7
27
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0
164
42
16
14
25
1.87
43045991--43046117
54
2.4
54
89
0
191
42
16
14
25
1.87
43049293--43049340
18
2.7
18
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39
14
22
22
1.91
43049694--43049902
27
7.7
27
80
6
217
37
17
17
27
1.92
43049689--43049902
81
2.6
82
83
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256
37
17
17
27
1.92
43053936--43054087
40
3.8
40
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173
28
23
26
22
1.99
43053973--43054102
40
3.2
40
84
2
181
25
23
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43061062--43061167
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2.0
52
100
0
212
18
15
13
52
1.74
43063413--43063463
25
2.0
25
100
0
102
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19
27
19
1.96
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2.2
15
100
0
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24
0
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66
1.20
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20
2.0
20
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0
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21
24
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2.0
30
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0
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37
4
24
32
1.77
43073567--43073739
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3.7
46
79
10
217
22
20
27
29
1.99
43073564--43073734
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1.8
93
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0
315
22
21
28
28
1.99
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2.0
36
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37
1.75
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82
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220
23
27
24
24
2.00
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23
27
23
25
2.00
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2.8
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263
28
19
28
22
1.98
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28
20
28
22
1.98
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2.9
15
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73
0
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1.08
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0
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1.82
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1
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1.39
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27
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0
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1.40
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0
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0
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0
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49
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0
201
28
10
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29
1.90
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2.1
37
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0
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22
1.97
43124888--43124988
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43132841--43132941
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
43134575--43134793
29
7.6
29
96
0
393
27
16
31
24
1.96
43134543--43134788
58
4.2
58
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2
388
26
17
30
25
1.97
43134543--43134793
87
2.9
87
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2
398
27
17
31
24
1.97
43135277--43135375
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2.4
41
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11
114
25
25
25
24
2.00
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37
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1.96
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29
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22
1.97
43140489--43140632
28
5.0
30
70
15
117
29
29
17
22
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410