Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  179  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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3.8
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20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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3.7
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0
0
39
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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29
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22
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54915290--54915478
81
2.3
81
83
1
218
26
16
20
36
1.93
54915290--54915459
54
3.1
54
83
3
155
28
15
20
36
1.92
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18
3.5
17
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10
63
68
3
15
12
1.33
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23
2.4
21
90
9
86
73
3
3
19
1.15
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12
2.7
14
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8
58
75
8
8
8
1.21
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5
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5
76
18
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3
16
1
0.98
54933018--54933072
16
3.6
14
83
14
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78
3
16
1
0.98
54933136--54933177
12
3.4
12
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4
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2
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54933136--54933165
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13
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0
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2.1
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0
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0
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0
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25
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21
2.1
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18
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2.1
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18
18
1.87
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2.7
30
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25
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26
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1.99
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28
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23
1.99
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40
86
2
304
27
27
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
23
22
1.99
54963490--54963705
79
2.7
79
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5
296
25
28
23
22
1.99
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6.4
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320
27
28
21
22
1.99
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2.1
16
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0
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2.5
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1.99
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27
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24
1.99
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18
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55010870--55010907
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10
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7
0
15
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
55010870--55010920
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2.3
21
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1
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2
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55011823--55011889
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3.2
31
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5
101
27
28
15
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410