Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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This is table  361  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111138814--111138873
20
3.0
19
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9
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1
6
25
1.25
111138814--111138873
10
6.0
10
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61
66
1
6
25
1.25
111142180--111142236
25
2.3
25
100
0
114
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14
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0
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2.2
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0
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15
0
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1.38
111144934--111144982
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2.4
21
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3
64
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2
55
1.52
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6.0
11
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18
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2
0
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2.1
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2
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125
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0
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3.2
20
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1
4
28
1.21
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14
280
27
19
19
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3.4
175
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27
19
18
34
1.95
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3.5
15
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15
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42
12
24
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1.87
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2.2
37
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105
59
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1
35
1.23
111163282--111163371
38
2.3
39
81
16
114
58
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1
36
1.22
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25
13.1
26
66
17
97
59
2
5
32
1.34
111163323--111163379
23
2.4
25
82
11
66
61
1
0
36
1.07
111163298--111163418
14
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14
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22
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60
1
4
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1.28
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2.0
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100
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14
0
21
64
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16
2.5
16
84
8
55
45
0
2
52
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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151
25
32
15
26
1.96
111173089--111173198
29
4.0
26
85
5
87
25
32
15
26
1.95
111173117--111173233
29
4.0
29
89
0
153
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31
14
26
1.95
111182853--111182988
67
2.0
67
95
0
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11
43
1.73
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11
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1
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130
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18
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0
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0
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1
0
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1.11
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1.9
18
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1.80
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2.0
81
100
0
324
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9
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1.65
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26
1.9
26
95
0
91
46
8
12
34
1.70
111199941--111200130
3
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3
78
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199
63
1
3
32
1.19
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6.0
44
71
11
150
28
18
21
31
1.97
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179
2.9
179
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745
28
17
21
31
1.96
111202640--111202783
46
3.1
46
87
2
200
26
27
15
30
1.96
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3
34.7
3
76
3
93
63
0
7
28
1.29
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13
2.9
13
84
3
51
28
0
10
61
1.28
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211
2.0
211
99
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33
13
15
38
1.86
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2.1
43
91
2
148
53
13
3
29
1.55
111230338--111230377
19
2.2
18
95
4
71
42
15
2
40
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111234183--111234270
42
2.1
42
93
0
149
51
14
4
29
1.62
111234295--111234353
19
3.2
19
97
2
111
42
15
3
38
1.63
111240515--111240616
53
1.9
53
94
4
179
32
23
19
24
1.98
111241162--111241206
22
2.0
22
95
0
81
26
11
13
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1.75
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22
2.2
22
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14
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1.75
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14
100
0
60
43
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13
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1.82
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2.1
19
100
0
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0
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1.51
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0
30
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19
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27
20
19
32
1.97
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2.0
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108
62
10
2
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1.39
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70
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0
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29
1.09
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17
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8
82
68
0
4
28
1.08
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2.8
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65
0
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10
12
0
0.98
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3
57
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2.1
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9
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38
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1
52
1.39
111261926--111261963
19
2.0
19
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10
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Percent
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Percent
Indels
Score
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2
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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201
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24
10
31
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410