Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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This is table  101  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29718770--29718794
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0
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3.6
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100
0
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60
28
0
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1.32
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0
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0
0
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0
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2.0
20
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0
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
545
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16
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1.94
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301
33
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16
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1.94
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0
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0
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100
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0
0
50
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0
0
50
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1.20
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2.2
24
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23
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23
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2.0
32
96
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15
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24
2.2
25
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3
36
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57
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24
2.1
24
82
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54
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4.2
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32
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1.98
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20
2.0
20
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57
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21
0
68
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.1
25
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28
1.61
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2.4
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239
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13
29
1.77
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1.9
51
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144
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5
4
34
1.40
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42
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15
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3
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2.5
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62
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19
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2
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0
58
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0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29926253--29926292
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2.0
21
85
14
57
25
5
5
65
1.34
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31
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54
1
1
43
1.15
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10
5.0
10
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0
0
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2.0
30
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1.84
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2.0
101
100
0
406
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6
38
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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503
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29
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20
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0
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32
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28
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25
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25
2.00
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25
20
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1.99
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208
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1.99
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1.99
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1.99
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23
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2.0
36
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0
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0
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31
2.5
31
95
0
138
16
21
37
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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347
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0
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29
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3.3
22
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1.96
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37
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24
23
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2.00
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20
2.6
20
88
11
88
15
26
32
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30065703--30066277
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2.0
284
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1.97
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60
28
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0
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151
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0
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0
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0
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410