Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  410  ( 49152 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1029157--1029368
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2.5
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18
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1.98
1044532--1044833
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19
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197
82
9
587
26
15
22
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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71
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15
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166
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2
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18
20
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1.96
1070646--1071153
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75
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29
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19
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1.94
1070646--1071363
88
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28
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14
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20
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13
100
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0
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50
38
44
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17
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
26
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0
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14
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145
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16
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1177677--1178237
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34
21
15
27
1.94
1177687--1178381
217
3.1
218
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1000
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21
16
28
1.95
1178217--1178251
14
2.5
14
90
0
52
62
5
14
17
1.49
1178146--1178326
91
2.0
88
87
3
254
37
19
17
25
1.93
1178081--1178383
165
1.9
161
88
2
453
32
20
16
29
1.95
1178242--1178383
74
1.9
75
89
2
223
28
23
17
30
1.97
1178345--1178464
59
2.0
60
86
1
170
40
16
12
30
1.85
1183235--1183384
17
8.5
17
86
5
210
39
12
12
36
1.80
1183235--1183384
35
4.3
35
93
3
214
39
12
12
36
1.80
1183235--1183384
52
2.8
52
93
2
246
39
12
12
36
1.80
1183865--1183924
17
3.5
17
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21
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33
1
0
65
1.03
1183866--1183924
16
3.5
16
76
23
59
33
1
0
64
1.04
1183901--1183950
26
1.9
26
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0
64
36
4
0
60
1.16
1186221--1186253
17
1.9
17
93
0
57
12
3
39
45
1.57
1186869--1187173
143
2.2
139
88
6
445
38
17
16
28
1.90
1187030--1187516
176
2.8
172
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6
655
38
18
16
26
1.92
1187030--1187500
86
5.4
86
84
5
574
36
19
16
27
1.93
1188253--1188306
7
7.7
7
78
0
54
24
0
25
50
1.50
1188261--1188345
21
3.9
21
75
11
89
28
1
25
44
1.61
1188272--1188361
46
2.0
46
97
0
171
30
2
25
42
1.67
1188388--1188516
7
18.1
7
68
7
55
23
0
39
36
1.60
1194274--1194328
25
2.2
24
81
12
58
58
1
1
38
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1194330--1194547
43
5.1
44
77
7
234
27
18
26
27
1.98
1194352--1194564
86
2.5
85
88
3
311
25
20
27
26
1.99
1206502--1206528
11
2.5
11
100
0
54
55
7
7
29
1.55
1206632--1206673
21
2.0
20
95
4
75
54
4
4
35
1.42
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44
4.0
42
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11
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3
3
37
1.32
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13
2.9
14
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7
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56
0
0
43
0.99
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23
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22
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19
108
55
4
3
37
1.34
1206695--1206798
22
4.5
22
75
17
88
56
2
0
39
1.21
1206737--1206813
22
3.2
24
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16
70
54
6
1
37
1.35
1207013--1207084
3
24.0
3
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0
117
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0
4
31
1.13
1208032--1208120
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1.9
46
97
0
169
28
21
8
41
1.83
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21
2.4
21
89
0
73
16
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50
1.75
1215081--1215130
21
2.4
21
86
0
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14
26
10
50
1.73
1216214--1216256
21
2.0
21
100
0
86
32
13
39
13
1.85
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16
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53
0
0
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1.00
1221118--1221178
26
2.3
26
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10
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40
32
4
21
1.74
1221171--1221211
15
2.7
15
84
0
55
39
29
4
26
1.77
1221263--1221340
38
2.1
38
97
0
147
48
19
5
26
1.69
1221267--1221354
38
2.3
38
90
1
124
48
17
5
28
1.69
1225279--1225346
9
7.6
9
78
6
75
47
19
7
26
1.75
1225278--1225346
18
3.8
18
79
7
86
47
18
7
26
1.74
1225278--1225346
36
1.9
36
90
0
111
47
18
7
26
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1226181--1226218
4
9.5
4
94
0
67
26
2
23
47
1.65
1228995--1229038
22
2.0
22
100
0
88
45
9
9
36
1.68
1229890--1229922
17
2.0
16
94
5
57
54
0
0
45
0.99
1229963--1230014
14
3.7
14
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61
65
1
0
32
1.04
1229963--1230024
14
4.2
15
81
8
58
62
1
0
35
1.05
1230669--1230933
105
2.5
105
92
0
431
43
12
18
25
1.85
1231267--1231375
26
4.2
26
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2
175
34
5
22
36
1.78
1231267--1231375
51
2.1
52
91
1
175
34
5
22
36
1.78
1233392--1233526
26
5.2
26
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0
227
34
5
24
36
1.78
1235009--1235061
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410