Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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Score
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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Indices
Period
Size
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Number
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A
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(0-2)
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5
181
39
5
12
42
1.65
11422886--11423203
127
2.5
127
84
2
406
35
20
16
26
1.94
11425307--11425335
15
2.0
15
93
6
51
0
13
6
79
0.93
11425769--11425852
44
1.9
44
82
4
107
25
25
22
27
2.00
11425765--11425937
51
3.7
45
70
13
136
28
23
19
28
1.98
11425765--11426034
137
1.9
139
84
2
355
28
22
18
29
1.98
11425902--11426213
92
3.4
91
85
2
401
29
19
19
31
1.97
11426233--11426348
44
2.7
43
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8
135
32
21
17
28
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11437704--11438002
127
2.4
127
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3
397
36
19
16
26
1.93
11438585--11438610
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
11440111--11440149
15
2.5
15
87
8
51
0
17
10
71
1.12
11440670--11440727
21
2.8
20
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14
91
48
8
10
32
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11443734--11443776
20
2.1
21
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12
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48
0
25
25
1.51
11446402--11446435
17
2.1
17
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5
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26
8
11
52
1.67
11447245--11447320
34
2.2
34
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28
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17
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1.97
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8
13
1.74
11459917--11459965
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3.2
15
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0
6
26
1.14
11459741--11460178
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73
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2
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1.33
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22
2.0
22
81
9
52
65
6
4
23
1.37
11459741--11460178
142
3.1
138
84
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571
63
2
6
27
1.33
11459741--11460178
215
2.1
208
85
4
583
63
2
6
27
1.33
11472389--11472428
15
2.7
15
88
7
55
60
5
0
35
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
40
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4
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34
19
23
22
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7
15.5
8
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16
0
39
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1.54
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7
11.4
7
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16
1
40
41
1.56
11473744--11473789
14
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2
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2
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1.67
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202
2.0
202
95
0
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2
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1.69
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1
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17
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5
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1.41
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1.63
11479117--11479226
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107
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16
2
33
1.61
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19.0
9
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0
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1.50
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1.62
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2
19.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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20
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34
2
8
55
1.42
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18
3.7
18
70
11
55
46
0
4
48
1.22
11495515--11495552
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2.1
18
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19
2.5
19
86
3
60
34
10
2
53
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11496721--11496792
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2.3
31
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13
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34
5
0
59
1.21
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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5.2
26
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0
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5
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2.1
136
94
0
500
24
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25
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2.0
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32
19
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2.0
23
100
0
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29
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0
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0
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0
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0
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22
0
0.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410