Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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15
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20
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0
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52
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2.7
13
86
0
52
5
34
34
25
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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13
4.2
13
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17
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3
0
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1.12
8794422--8794475
18
2.9
18
76
15
56
62
3
0
33
1.12
8794436--8794513
16
4.3
17
73
16
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2
2
25
1.14
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2.1
30
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5
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1.56
8810388--8810468
32
2.5
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1.50
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0
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136
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18
25
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12
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55
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2
0
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1.11
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2.2
20
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1.09
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3.1
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51
12
7
2
76
1.09
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3.3
30
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18
1.69
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18
3.3
18
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28
57
22
48
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22
1.75
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7
4.1
7
100
0
58
13
27
13
44
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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0
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25
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28
1.98
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50
2.5
51
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181
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20
18
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1.95
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0
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0
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2.0
20
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80
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0.70
8866772--8866813
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80
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0
37
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8914237--8914265
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0
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28
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2
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14
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1.94
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42
2.5
42
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0
196
22
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28
1.94
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27
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28
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32
25
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1.94
8925880--8925986
42
2.5
42
96
0
196
22
33
14
28
1.94
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13
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20
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8931579--8931750
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8944336--8944377
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14
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33
4
2
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1.31
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0
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17
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12
100
0
50
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0
16
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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30
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2.0
21
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14
43
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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0
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0
7
45
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410