Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  305  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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1.96
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71
100
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53
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2
20
4
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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25
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232
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21
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94537702--94537726
13
1.9
13
100
0
50
48
8
32
12
1.69
94543064--94543136
37
2.0
37
94
0
128
39
6
4
49
1.49
94544348--94544388
20
2.0
21
85
4
57
53
2
0
43
1.13
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18
1.9
18
88
0
52
45
11
0
42
1.40
94553316--94553358
19
2.2
20
87
8
61
30
4
2
62
1.28
94554172--94554266
27
3.7
23
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17
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33
2
2
62
1.19
94554174--94554267
9
10.9
8
70
21
57
34
2
2
61
1.20
94557696--94557986
105
2.7
107
81
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329
39
19
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31
1.84
94570542--94570584
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2.0
21
95
0
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23
23
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1.69
94573695--94573755
30
2.0
30
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45
6
13
34
1.69
94576892--94577030
48
2.9
48
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0
188
19
15
31
33
1.93
94581973--94582405
140
3.1
140
92
0
677
27
18
24
29
1.98
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2.0
117
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1
340
28
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24
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1.97
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125
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126
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2
316
27
16
22
34
1.95
94582882--94582960
7
11.0
7
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5
59
18
0
30
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1.47
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0
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25
0
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31
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31
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8
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1.56
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0
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0
14
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17
1.9
17
100
0
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12
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18
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94597294--94597328
18
1.9
18
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0
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11
14
11
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2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
94600994--94601179
75
2.5
75
85
1
257
26
12
17
42
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94601362--94602084
35
19.7
37
75
8
497
27
20
14
37
1.91
94601362--94602081
38
19.6
37
75
10
424
27
20
14
37
1.92
94601371--94602081
73
9.7
74
76
9
545
26
20
14
38
1.91
94602959--94603023
35
1.9
33
87
6
94
53
3
1
41
1.25
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864
2.0
863
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0
3220
22
23
21
33
1.98
94620613--94620889
48
5.8
47
76
14
237
23
29
19
26
1.98
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39
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214
37
20
25
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1.93
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2.0
46
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0
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23
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24
1.97
94636015--94636187
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1.8
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3
258
27
17
30
24
1.97
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3.5
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10
43
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11
186
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10
32
1.84
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3.7
43
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15
150
23
16
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32
1.96
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40
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25
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2.00
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2.6
80
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2
236
26
25
22
26
2.00
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2.5
31
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0
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14
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42
2.7
45
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12
155
22
30
19
27
1.98
94660640--94660766
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2.9
39
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19
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22
30
18
27
1.98
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39
2.5
40
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1
132
30
22
24
21
1.99
94663018--94663199
40
4.6
40
82
4
181
28
22
26
23
1.99
94671116--94671286
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10
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28
21
26
23
1.99
94688538--94688598
30
2.0
30
87
0
86
40
3
24
31
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94689264--94689413
67
2.3
64
80
8
160
29
16
28
26
1.96
94689403--94689587
50
3.7
49
87
2
237
25
17
26
30
1.98
94702599--94702806
40
5.2
40
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4
213
25
25
22
26
2.00
94702599--94702805
80
2.6
80
82
2
236
26
25
22
26
2.00
94706855--94706930
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0
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1.93
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203
22
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19
27
1.98
94708003--94708313
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15
251
24
28
19
28
1.98
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2.2
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360
24
28
19
28
1.98
94713696--94713755
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2.0
30
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0
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5
100
0
84
38
0
0
61
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410