Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  30  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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2.4
16
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0
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51
20
5
23
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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19
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203
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1.94
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1.9
147
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1
442
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23
22
1.94
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2.0
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21
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3.4
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53
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2.0
25
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2.0
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25
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4.2
26
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175
36
23
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183
2.0
183
96
0
684
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15
14
42
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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548
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11
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1.52
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351
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12
1
38
1.52
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17
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12
1
39
1.49
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2.1
203
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26
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36
100
0
146
30
10
23
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7597955--7597991
2
18.5
2
91
0
56
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0
2
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46
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13
186
28
28
20
22
1.99
7600300--7600470
93
1.8
93
91
0
279
28
28
21
21
1.98
7602142--7602184
19
2.2
20
84
8
54
23
18
0
58
1.40
7603042--7603263
110
2.0
111
91
0
356
30
16
20
32
1.95
7604921--7605271
105
3.4
104
87
2
461
35
13
16
33
1.89
7638311--7638348
2
19.5
2
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5
60
44
0
2
52
1.14
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45
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10
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29
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25
1.99
7649951--7650654
135
5.2
135
89
0
978
30
21
22
26
1.99
7652330--7652368
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
7653425--7653533
26
4.2
26
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1
175
33
5
24
35
1.79
7660350--7660386
15
2.5
15
84
16
51
43
0
2
54
1.14
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20
2.0
20
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0
51
41
0
2
56
1.13
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10
4.7
10
81
0
58
61
0
2
36
1.08
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30
2.0
30
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1
1
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1.16
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28
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12
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1.65
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2.0
21
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0
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2.0
92
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21
1.9
20
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5
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25
1.57
7677767--7677819
18
3.1
18
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0
0
49
1.00
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44
0
0
55
0.99
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9
6.4
9
89
4
80
38
26
10
24
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7683663--7683719
26
2.1
27
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3
98
38
26
10
24
1.88
7683727--7683824
17
5.4
17
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13
70
51
14
4
30
1.61
7683718--7683832
37
3.1
36
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3
194
47
14
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31
1.69
7686363--7686401
19
2.1
19
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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0
0
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0
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15
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0
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23
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0
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0
0
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100
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0
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0
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0
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2.3
45
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1
138
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19
17
21
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7734347--7734373
6
4.5
6
100
0
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18
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2.0
40
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0
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0
0
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24
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0
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18
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0
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33
0
9
57
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410