Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  177  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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1.03
Indices
Period
Size
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A
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(0-2)
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34
34
1.82
54363677--54363753
30
2.6
30
71
8
75
29
28
15
25
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10
2.7
10
100
0
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11
18
1.85
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10
2.7
10
100
0
54
40
29
11
18
1.85
54375085--54375124
19
2.1
19
85
0
53
25
35
17
22
1.95
54378186--54378263
30
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78
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16
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29
1.97
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11
5.5
10
73
22
55
78
0
17
3
0.88
54379540--54379596
5
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5
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20
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78
0
17
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100
0
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1.83
54379677--54379701
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
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1.02
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18
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2
18
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1.26
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30
2.7
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1
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26
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13
2.2
13
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0
58
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0
10
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1.95
54397183--54397270
30
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28
28
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1.96
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45
2.0
46
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2
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19
20
1.94
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13
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70
9
1
5
82
0.91
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12
3.5
12
86
0
66
9
2
7
80
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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4
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2
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5
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17
53
79
2
16
2
0.93
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22
2.1
22
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8
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1.97
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2.0
106
100
0
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19
19
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2.7
10
100
0
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29
11
18
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54491913--54492000
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2.9
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0
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28
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27
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181
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19
19
1.96
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23
2.0
23
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28
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20
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0
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0
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10.2
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0
18
0
0.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410