Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  407  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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0
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
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Score
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122909891--122909983
43
2.2
43
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3
152
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6
13
51
1.66
122910215--122910264
25
2.0
25
100
0
100
20
20
12
48
1.80
122915374--122915410
19
1.9
19
88
0
56
45
5
16
32
1.70
122915423--122915473
24
2.1
24
88
0
75
31
13
5
49
1.66
122924648--122924711
19
3.4
19
82
4
76
35
12
6
45
1.67
122924709--122924843
38
3.7
38
73
14
131
47
5
13
34
1.65
122924785--122924844
19
3.1
19
70
2
57
48
5
15
31
1.66
122924842--122924911
19
3.8
19
76
16
76
34
21
5
38
1.77
122925613--122925793
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1.8
97
91
4
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32
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11
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1.90
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11
100
0
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0
42
1.56
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2.4
22
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43
1
0
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399
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2401
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37
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3
6
30
1.39
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21
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13
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3
25
1.14
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10
3.1
10
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8
55
87
0
0
12
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69
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0
1.07
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26
2.9
26
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0
105
70
8
20
1
1.19
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14
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1
1.20
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2.1
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0
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0
32
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61
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200
1.8
195
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7
497
25
11
15
47
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122979478--122979504
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100
0
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0
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12
2.1
12
100
0
50
16
0
8
76
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122987947--122988119
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5
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15
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107
2.5
110
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391
37
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14
26
1.92
122991963--122992024
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2.8
21
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29
0
3
67
1.06
122991976--122992013
13
2.7
14
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31
0
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22
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1.38
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2.0
38
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23
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23
2.0
23
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2.1
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6
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0
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2.0
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2
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0
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26
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0
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0
0
50
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4.6
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96
4
55
0
16
0
83
0.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123055099--123055128
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0
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30
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123062205--123062254
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12.5
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0
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0
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0
0
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0
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35
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7
45
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410