Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  204  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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2.8
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2.1
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2.7
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0
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32
22
25
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.94
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41
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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30
24
16
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62528183--62528213
16
1.9
16
100
0
62
22
25
12
38
1.90
62531549--62531697
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
62531590--62531697
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
62539665--62539813
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
62539706--62539813
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
62541549--62541873
48
6.8
47
77
8
291
28
25
19
26
1.99
62547953--62547992
20
2.0
20
85
9
55
27
25
20
27
1.99
62550266--62550334
3
23.0
3
100
0
138
66
0
0
33
0.92
62551813--62551925
33
3.4
33
75
13
108
30
15
26
28
1.96
62551681--62551871
105
1.9
101
84
6
258
31
15
25
27
1.96
62551681--62551926
105
2.4
101
79
7
255
31
15
25
26
1.96
62561890--62561983
40
2.3
40
77
13
104
29
11
26
31
1.92
62566503--62566624
43
2.9
42
82
6
129
31
22
18
27
1.97
62575774--62575994
40
5.6
40
84
6
272
28
26
21
24
1.99
62578968--62579135
40
4.2
40
85
5
198
26
27
22
23
1.99
62578968--62579135
80
2.1
80
86
4
232
26
27
22
23
1.99
62586978--62587145
40
4.2
40
85
5
198
26
27
22
23
1.99
62586978--62587145
80
2.1
80
86
4
232
26
27
22
23
1.99
62594958--62595001
22
2.0
22
86
8
63
45
13
9
31
1.75
62595258--62595449
40
4.8
40
89
0
303
26
26
22
24
2.00
62595234--62595449
80
2.7
80
87
5
305
26
25
22
24
2.00
62599203--62599272
25
2.8
25
82
0
77
37
21
18
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62600710--62600877
46
3.6
46
75
15
134
29
16
29
24
1.97
62600710--62600884
93
1.9
94
80
11
207
29
17
29
24
1.97
62604336--62604484
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
62604377--62604484
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
62616377--62616415
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
62624631--62624784
43
3.6
43
75
11
136
25
17
25
31
1.97
62624634--62624746
44
2.6
44
80
8
117
24
19
25
30
1.98
62626419--62626505
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
62626419--62626527
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96
62626419--62626527
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
62634202--62634288
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
62634202--62634310
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96
62634202--62634310
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
62637480--62637566
38
2.3
38
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7
97
34
27
18
19
1.95
62640108--62640132
5
5.0
5
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0
50
20
0
0
80
0.72
62641200--62641228
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2.2
13
100
0
58
41
20
13
24
1.89
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40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
62644752--62644880
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
62652726--62652892
40
4.2
40
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169
26
22
26
24
2.00
62660743--62660884
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
62660782--62660910
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
62666781--62666853
33
2.2
33
85
2
94
23
28
32
15
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62668522--62668572
3
17.3
3
95
4
95
68
0
0
31
0.90
62670027--62670107
41
1.9
43
90
5
130
24
19
25
29
1.99
62670025--62670120
41
2.3
41
82
10
124
22
18
27
31
1.97
62680314--62680416
41
2.5
42
80
4
136
25
19
26
29
1.99
62691226--62691264
19
2.1
19
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33
5
10
51
1.58
62691289--62691327
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15
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28
2
0
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1.02
62691307--62691338
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13
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31
0
0
68
0.90
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1.8
93
96
0
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20
1.98
62695209--62695384
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
62697767--62697855
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410