Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  205  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62697767--62697846
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5.4
15
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10
1.62
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0
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3.0
30
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20
1.98
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3.0
30
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1.65
62707268--62707347
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
62707279--62707356
15
5.2
15
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56
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93
96
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20
1.98
62710288--62710463
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232
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29
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1.98
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2.2
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5
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2.6
42
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30
28
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1.93
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47
2.7
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1
156
30
26
14
28
1.95
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256
26
25
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28
1.99
62719647--62719770
50
2.5
51
89
4
180
26
20
16
36
1.94
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3.5
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1
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28
1.98
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28
2.0
28
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1
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1.61
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2.8
37
93
0
179
25
32
19
23
1.98
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10.9
48
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0
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28
6
34
1.82
62732705--62732779
26
2.9
26
78
11
73
40
24
21
14
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62740282--62740313
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2.0
16
100
0
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12
25
18
1.85
62745437--62745694
44
6.0
43
79
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190
27
27
19
25
1.99
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87
2.1
87
85
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238
26
29
20
23
1.99
62746358--62746498
46
3.0
47
91
5
225
44
15
11
28
1.81
62753024--62753242
88
2.5
88
84
5
273
26
28
19
25
1.99
62753024--62753242
45
5.0
44
82
5
239
26
28
19
25
1.99
62754049--62754235
46
4.0
47
91
2
281
44
13
11
29
1.80
62757209--62757333
55
2.3
54
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5
135
19
27
35
18
1.95
62761660--62761805
65
2.2
65
81
4
170
34
24
19
21
1.96
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3.3
80
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4
381
24
27
22
24
2.00
62770617--62770880
119
2.2
121
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7
353
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27
22
24
2.00
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7.1
40
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330
24
27
22
25
2.00
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80
88
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363
24
28
22
24
1.99
62778747--62779027
40
7.1
40
80
9
310
24
28
22
24
1.99
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40
4.4
40
81
3
185
26
23
26
23
2.00
62785643--62785859
80
2.7
80
80
5
224
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23
26
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3.8
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81
6
141
26
25
25
22
2.00
62798824--62798939
43
2.7
43
77
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32
16
22
28
1.95
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26
1.9
26
100
0
100
36
12
28
24
1.91
62802200--62802357
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2.3
68
78
11
169
20
29
16
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2.0
27
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55
7
0
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1.27
62812964--62813130
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62812964--62813130
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
62813955--62814000
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
62820966--62821130
40
4.2
40
79
5
167
24
27
21
25
1.99
62820982--62821090
38
2.8
37
84
5
128
24
30
22
22
1.99
62820982--62821129
78
1.9
77
83
6
192
24
28
22
25
1.99
62821955--62822000
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
62827715--62827844
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
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53
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0
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1.11
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2.1
19
85
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48
7
5
38
1.54
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19
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1.06
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0
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33
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13
13
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24
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10
163
54
3
1
40
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62854093--62854182
45
2.0
45
93
2
155
24
12
24
38
1.89
62858895--62858940
3
15.3
3
90
0
65
36
0
4
58
1.18
62859321--62859377
25
2.4
23
82
11
62
42
5
12
40
1.65
62862248--62862357
26
4.2
26
96
0
193
37
24
4
33
1.76
62863830--62863936
38
2.7
39
73
9
94
24
20
25
29
1.99
62864805--62864851
3
15.7
3
100
0
94
68
0
0
31
0.90
62865014--62865178
40
4.2
39
82
3
188
16
18
26
38
1.92
62865014--62865178
78
2.1
78
87
1
240
16
18
26
38
1.92
62866718--62866820
49
2.1
49
98
0
197
34
11
13
39
1.81
62869310--62869349
15
2.6
16
88
11
66
62
7
0
30
1.23
62869419--62869568
75
2.0
75
100
0
300
33
12
12
42
1.79
62870825--62870871
24
2.0
24
91
0
76
46
0
36
17
1.48
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29
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13
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14
28
1.94
62874085--62874118
16
2.1
16
94
0
59
35
23
0
41
1.55
62874163--62874200
19
2.1
19
90
5
60
18
39
15
26
1.91
62875514--62875546
16
2.1
16
94
0
57
15
6
30
48
1.69
62877551--62877593
19
2.1
21
87
8
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34
20
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34
1.85
62879326--62879368
3
14.3
3
100
0
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0
0
32
0.91
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2
20.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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19
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5
54
7
29
0
62
1.22
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16
3.5
16
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44
7
21
26
1.78
62896109--62896267
39
4.1
39
90
0
239
26
30
21
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62899702--62899777
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2.5
30
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4
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26
25
10
38
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62899809--62899871
30
2.1
30
90
0
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25
25
17
31
1.97
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29
2.5
30
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2
114
16
31
13
39
1.87
62899911--62900010
29
3.4
29
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1
173
27
28
12
33
1.92
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11
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11
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20
15
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1.61
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8.0
9
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33
1
1
63
1.12
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17
7.2
18
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22
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2
2
63
1.20
62901935--62902066
9
14.6
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72
15
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2
2
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0
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0
0
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2.0
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0
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22
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37
1.84
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19
2.4
18
82
10
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0
68
1.13
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1
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29
1.26
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2.3
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3
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28
1.41
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2.1
17
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12
0
78
0.95
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21
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2
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18
1.19
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2
100
0
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0
0
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1.00
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114
27
19
23
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1.98
62912297--62912340
16
2.8
16
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3
54
43
31
2
22
1.66
62912446--62912499
22
2.5
22
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50
24
0
25
1.50
62912954--62913082
42
3.1
42
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4
136
22
2
32
42
1.66
62912982--62913055
21
3.5
21
71
14
71
20
1
35
43
1.60
62913002--62913072
21
3.4
20
70
16
63
21
2
30
45
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62913336--62913618
84
3.4
84
82
3
243
31
14
23
30
1.95
62913399--62913618
84
2.6
84
85
2
291
30
15
21
32
1.94
62913983--62914015
16
2.1
16
94
0
57
15
12
15
57
1.65
62916272--62916314
16
2.7
15
80
20
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46
6
0
46
1.30
62916384--62916430
3
15.3
3
95
4
85
65
0
0
34
0.93
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0
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0
0
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0
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0
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9
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1.68
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45
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0
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1.65
62922120--62922148
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410