Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  175  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.00
53886780--53886836
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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76
1.02
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1.08
Indices
Period
Size
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53967255--53967331
16
4.9
14
75
19
64
72
2
20
3
1.12
53967255--53967331
31
2.5
31
79
12
86
72
2
20
3
1.12
53970521--53970617
30
3.2
31
75
5
101
27
27
15
28
1.96
53972803--53972974
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
53972796--53972971
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
53974758--53975115
178
2.0
178
98
0
689
27
24
12
36
1.91
53980519--53980693
45
3.8
46
79
13
216
29
29
20
20
1.98
53980526--53980696
93
1.8
92
96
1
315
28
29
21
21
1.98
53983894--53983932
13
2.9
13
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17
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0
17
2
79
0.84
53984847--53984904
12
4.8
12
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10
82
17
3
6
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1.21
53984848--53984891
13
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13
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3
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13
2
6
77
1.07
53984847--53984917
12
5.8
12
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9
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14
5
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71
1.28
53984847--53984915
13
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11
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1.24
53987999--53988096
30
3.3
30
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0
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29
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26
27
1.97
53993518--53993643
39
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39
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0
153
23
20
25
30
1.98
53997371--53997427
5
11.0
5
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20
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1
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77
1.00
53997371--53997427
16
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14
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1
17
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1.00
53997371--53997432
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21
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1
16
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1.02
54002612--54002640
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13
100
0
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0
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10
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22
22
14
1.90
54002864--54002912
21
2.4
21
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3
73
40
22
22
14
1.90
54004633--54004729
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54008948--54008976
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2.2
13
100
0
58
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10
0
27
1.28
54011608--54011634
10
2.7
10
100
0
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14
0
7
77
0.97
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19
2.1
19
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30
32
15
22
1.94
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14
3.4
14
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0
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18
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14
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0
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18
31
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43
1.75
54027095--54027177
30
2.7
30
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13
21
1
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1.35
54027128--54027183
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3.1
18
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5
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7
19
1
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1.18
54027153--54027177
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2.1
12
100
0
50
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10
7
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1.11
54028216--54028255
18
2.2
18
86
8
55
10
7
5
77
1.11
54028235--54028279
12
3.7
12
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14
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2.0
24
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0
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17
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1.30
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1.9
43
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0
103
15
7
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71
1.29
54040915--54040952
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2.0
20
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10
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2
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2
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0
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9
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0
0
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1.8
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27
29
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1.99
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46
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12
207
28
28
21
21
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11
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45
2.7
45
94
2
208
25
19
24
30
1.98
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1.9
13
100
0
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1.90
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30
3.2
30
76
2
97
28
14
26
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54055009--54055130
28
4.3
27
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29
34
13
22
1.92
54055009--54055130
57
2.2
56
85
4
156
29
34
13
22
1.92
54057226--54057333
26
4.2
26
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0
180
33
7
24
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14
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58
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8
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0
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1.00
54069924--54069980
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14
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60
3
17
1
77
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410