Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  380  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115638206--115638248
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2.0
21
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0
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9
1.87
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2.0
22
90
4
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2.3
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7
86
29
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1.65
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31
2.3
31
82
4
90
32
12
11
43
1.78
115648175--115648265
31
2.9
30
79
8
83
50
5
14
29
1.65
115654569--115654593
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2.1
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100
0
50
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8
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1.38
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0
2
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0.98
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0
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0
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0
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10
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1.8
254
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0
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19
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42
5.2
42
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23
23
23
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3.6
131
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0
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28
21
23
26
1.99
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261
1.8
262
91
1
795
28
21
23
26
1.99
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88
2.6
88
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2
275
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19
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1.97
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44
2.6
43
78
2
116
33
22
18
25
1.97
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3.0
44
73
9
141
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14
19
27
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45
3.2
45
71
8
130
36
16
18
28
1.93
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134
2.2
132
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2
350
29
16
24
29
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12
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0
50
16
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8
68
1.38
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16
2.5
15
84
12
51
23
0
2
74
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
115674373--115674441
33
2.3
28
76
23
86
30
7
4
57
1.45
115674380--115674446
33
2.0
33
100
0
134
31
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5
53
1.56
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52
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3
51
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22
2.8
23
78
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71
52
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1
38
1.40
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0
0
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1
38
1.40
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2.4
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55
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0
37
1.27
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0
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1.9
37
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2.0
169
93
0
578
28
26
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29
1.96
115693846--115693892
19
2.5
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0
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63
2
5
29
1.29
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26
2.0
27
82
10
67
64
3
5
25
1.32
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23
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3
33
1.32
115704335--115704404
18
3.9
17
77
18
63
61
1
4
32
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115709811--115709847
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2.9
27
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11
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26
6
7
58
1.50
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1
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51
96
0
3
0
0.21
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2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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1.9
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0
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2
48
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1.58
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10
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3
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1.40
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2.0
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13
124
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3
56
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115726307--115726414
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15
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5
5
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3.5
24
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12
70
31
5
5
57
1.46
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2.2
49
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119
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5
5
59
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23
2.8
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16
57
32
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5
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52
31
2
2
62
1.24
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192
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1.90
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74
2.4
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23
11
31
1.90
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30
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92
0
136
27
47
6
17
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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6
6
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1.52
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1.93
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1
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20
1.91
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2.0
17
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0
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0
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0
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15
23
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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0
130
28
17
21
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115875787--115875924
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0
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0
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0.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410