Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  70  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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154
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1.95
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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28
1.98
19741657--19741843
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286
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14
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19804676--19804862
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2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
19804699--19804862
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
19804699--19804896
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
19812243--19812429
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
19812266--19812429
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
19812266--19812463
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
19814038--19814080
22
1.9
23
85
4
61
13
23
9
53
1.69
19815606--19815634
13
2.1
14
93
6
51
51
0
0
48
1.00
19819510--19819541
12
2.7
12
100
0
64
0
40
28
31
1.57
19820385--19820565
41
4.5
41
79
9
167
30
27
14
27
1.95
19820430--19820566
40
3.4
40
78
8
127
30
28
15
25
1.96
19824484--19824583
26
3.9
25
81
3
110
38
7
21
34
1.80
19827750--19827797
11
4.2
11
74
10
51
35
2
0
62
1.07
19831172--19831416
40
6.1
40
83
6
183
24
26
23
26
2.00
19831211--19831418
80
2.6
79
82
2
245
25
26
22
26
2.00
19833238--19833549
46
7.0
46
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6
426
37
15
24
22
1.92
19833248--19833505
84
2.9
87
90
5
387
36
15
24
22
1.94
19836505--19836624
6
19.3
6
68
19
68
49
13
16
20
1.79
19836514--19836624
31
3.5
31
90
1
159
49
12
17
20
1.79
19836723--19836824
27
3.8
26
87
5
123
36
20
23
19
1.95
19836983--19837047
22
3.0
22
84
8
87
35
23
21
20
1.96
19837436--19837628
27
7.2
27
85
1
219
25
19
18
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19837436--19837628
80
2.4
80
86
3
246
25
19
18
36
1.94
19837633--19837830
27
7.3
27
86
2
263
38
8
25
27
1.85
19837633--19837827
81
2.4
81
90
1
293
39
8
24
27
1.84
19837676--19837850
81
2.2
81
89
0
260
38
9
22
30
1.85
19837884--19838089
27
7.6
27
85
1
261
30
9
20
39
1.84
19840036--19840169
66
2.0
67
95
1
243
35
26
14
23
1.93
19847169--19847289
54
2.2
54
80
8
138
33
22
25
18
1.96
19847178--19847289
27
4.1
27
82
14
117
35
22
24
17
1.95
19847682--19847711
8
3.8
8
90
0
51
3
26
26
43
1.70
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26
2.2
26
96
0
103
37
26
5
30
1.79
19852214--19852330
34
3.4
34
78
4
119
29
19
22
29
1.98
19852717--19852767
15
3.3
16
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8
61
19
7
45
27
1.78
19853704--19853798
41
2.4
39
80
3
100
34
23
13
28
1.93
19854639--19854704
34
2.1
33
83
11
84
6
18
4
71
1.24
19857167--19857260
3
31.7
3
95
2
172
0
32
0
67
0.91
19858095--19858124
15
2.0
15
93
0
51
0
30
0
70
0.88
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22
2.0
22
86
8
63
34
0
36
29
1.58
19860319--19860362
22
2.0
22
86
8
63
31
0
38
29
1.58
19872286--19872322
18
2.0
19
94
5
67
37
5
16
40
1.71
19875615--19875674
21
2.8
22
78
14
63
60
6
1
31
1.33
19875565--19875832
85
3.2
85
96
1
488
57
4
3
34
1.35
19875767--19875864
11
9.9
10
70
24
66
64
1
4
30
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19875796--19875872
10
7.5
11
73
17
60
63
1
3
31
1.20
19875800--19875873
19
3.8
19
77
15
71
63
1
4
31
1.21
19876544--19876621
24
3.2
24
66
25
65
38
3
3
53
1.37
19876566--19876645
24
3.3
24
68
25
78
43
3
1
51
1.27
19876544--19876661
48
2.5
48
94
1
202
39
3
2
54
1.31
19883728--19883837
43
2.6
42
81
8
132
31
16
23
28
1.96
19888311--19888380
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
19888311--19888392
27
3.0
27
84
8
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28
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25
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1.96
19896244--19896313
27
2.5
28
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2
115
27
14
28
30
1.95
19896244--19896325
27
3.0
27
84
8
69
28
15
25
30
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410