Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  266  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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82063180--82063301
7
16.9
7
69
13
50
22
1
34
40
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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1
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1.62
82063241--82063302
21
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22
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74
22
0
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2
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0
0
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1.98
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22
22
27
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189
24
22
25
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2.00
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20
2.2
20
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1.92
82115749--82115855
28
3.7
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74
26
28
19
26
1.99
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27
26
19
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1.99
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20
2.8
20
83
2
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33
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1.95
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2.0
40
88
2
119
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10
18
24
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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149
25
32
16
25
1.96
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2.2
44
92
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164
13
18
4
65
1.42
82155846--82155920
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6.9
11
74
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13
18
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39
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26
17
31
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82245151--82245199
25
2.0
24
92
4
80
18
2
14
65
1.37
82248076--82248160
40
2.2
40
95
2
154
34
22
16
27
1.95
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69
2.0
69
98
0
269
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26
1.93
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22
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0
123
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26
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24
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25
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15
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18
14
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2.1
109
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0
345
21
22
32
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1.98
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70
4.7
70
82
1
369
31
21
18
28
1.97
82290796--82290838
20
2.2
20
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0
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10
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20
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20
19
24
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1.95
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27
2.5
28
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2
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40
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2
200
25
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22
26
2.00
82316437--82316610
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4
197
21
20
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28
1.98
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1.98
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93
1.8
93
93
0
297
28
28
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1.98
82319422--82319594
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1.98
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0
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2.0
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1.98
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2
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0
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0
0
48
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1
30.0
1
93
0
51
0
0
3
96
0.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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42
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20
24
25
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3.3
85
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1.98
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50
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49
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21
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0
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1.95
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1.97
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2.3
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204
22
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131
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22
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3.9
40
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25
23
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82416969--82417151
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219
26
22
26
24
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82417001--82417155
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3.9
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23
26
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2.00
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41
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28
98
32
17
28
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410