Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  29  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
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0
21
0
0.75
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7
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2.0
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2.0
16
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40
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1.68
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2.7
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1.9
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27
19
18
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100
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2.5
14
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0
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20
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2
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1.58
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2.7
86
81
9
272
25
18
18
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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20
11
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16
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41
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17
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1.80
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2.1
81
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27
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29
1.83
7321892--7322142
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54
92
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394
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23
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1.83
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27
4.3
26
85
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140
36
22
23
17
1.95
7326749--7326863
54
2.1
54
87
3
160
36
22
23
17
1.95
7327274--7327304
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0
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5.2
26
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0
227
36
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5
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1.79
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22
2.0
20
85
9
55
24
2
17
56
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
20
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0
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1.49
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1.82
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26
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0
146
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1.84
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32
25
16
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1.96
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25
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19
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100
0
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20
16
16
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2.0
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20
12
12
55
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0
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15
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0
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0
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1
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9
19.4
9
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1
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19
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15
59
31
3
1
63
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7382823--7382952
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19
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0
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1.15
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16
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15
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72
0
2
25
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6
6.8
6
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5
73
47
0
0
52
1.00
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2.0
15
93
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0
20
6
72
1.07
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26
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13
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0
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0
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15
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24
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24
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0
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20
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0
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1.19
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30
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1.57
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20
2.0
20
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7
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2
20.0
2
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0
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0
0
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1.00
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25
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1.8
205
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12
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12
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0
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0
2
28
1.00
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14
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13
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23
53
60
3
5
30
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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0
3
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2.5
27
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1
4
49
1.32
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0
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25
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16
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1.8
88
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2.1
33
100
0
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28
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0
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2.9
22
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0
4
33
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7478236--7478305
35
2.1
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1
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1.20
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11
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60
0
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44
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27
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1.95
7480071--7480558
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2.2
219
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27
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1.96
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1.8
263
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0
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27
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1.95
7480074--7480558
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3.7
131
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27
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1.95
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2.1
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7
86
61
1
2
34
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410