Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  395  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119852164--119852194
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4
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0
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22
0
0
77
0.77
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15.3
18
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10
158
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15
12
35
1.85
119860794--119861076
36
7.6
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71
12
187
36
15
12
35
1.85
119860874--119861064
54
3.5
53
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11
174
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15
11
35
1.84
119860875--119861076
72
2.8
71
82
5
228
37
15
11
36
1.83
119861238--119861416
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45
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19
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0
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100
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63
0
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2.0
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6
96
0
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1.57
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13
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51
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0
0
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100
0
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50
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0
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100
0
50
0
0
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1.00
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26
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3.8
40
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137
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21
28
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2.1
14
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0
51
46
20
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26
1.75
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3.2
55
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3
217
51
12
20
16
1.75
119920058--119920107
24
2.0
25
84
3
66
34
4
4
58
1.36
119921610--119921650
19
2.2
19
100
0
82
48
9
9
31
1.69
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30
2.0
30
96
0
113
29
29
13
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119932599--119932665
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36
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5
1
34
1.32
119932877--119933006
59
2.2
59
86
8
176
44
8
6
40
1.62
119932895--119933015
59
2.0
61
91
3
201
42
9
6
41
1.62
119933731--119933805
31
2.5
31
76
18
77
36
8
13
42
1.73
119933753--119933813
31
1.9
33
83
6
81
36
9
11
42
1.74
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2
100
0
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50
0
0
50
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2.0
20
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60
2
2
34
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2.0
17
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6
0
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1.26
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2.0
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2
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1.31
119947718--119947766
20
2.3
22
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13
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12
55
1.60
119947723--119947769
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2.3
20
100
0
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119951166--119951196
2
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2
100
0
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0
0
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22
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8
59
1.55
119960348--119960406
18
3.3
18
72
13
68
20
11
8
59
1.58
119960327--119960409
35
2.3
35
95
2
148
25
12
7
55
1.62
119960349--119960407
17
3.4
17
70
21
59
22
11
8
57
1.61
119965315--119965422
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2.0
53
92
0
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20
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100
0
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100
0
0
0
0.00
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3.0
50
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21
27
1.94
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7.5
31
92
0
358
28
18
26
27
1.98
119974084--119974112
7
4.1
7
100
0
58
44
13
27
13
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119974116--119974239
47
2.6
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155
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15
25
30
1.96
119995993--119996028
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7.2
5
93
0
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58
2
0
38
1.13
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5
97
2
89
77
0
0
22
0.77
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18
2.2
20
88
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63
41
0
2
55
1.12
120009290--120009453
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2.0
82
100
0
328
36
21
15
25
1.94
120010986--120011020
8
4.5
8
92
3
54
62
0
2
34
1.10
120011166--120011208
20
2.1
21
82
4
52
62
6
2
27
1.33
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0
0
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44
0
55
0
0.99
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50
18
0
4
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18
3.2
18
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19
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78
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14
0.96
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0
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2.7
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3
0
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58
1.15
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16
29
1.93
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10
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36
17
17
27
1.93
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2.4
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18
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1.95
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18
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19
19
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18
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18
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167
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3
1120
32
20
18
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
1.97
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74
1.9
75
85
5
198
28
22
16
32
1.96
120013659--120014470
337
2.4
337
88
4
1169
32
20
18
29
1.96
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25
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30
1.96
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2
2
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0
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1.98
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0
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1.98
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0
0
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2.0
30
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0
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35
25
15
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.6
39
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0
210
17
46
19
17
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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10
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34
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0
120
40
11
5
42
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410