Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  24  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6173938--6173970
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
6173985--6174058
21
3.4
21
76
10
60
55
4
0
40
1.19
6173983--6174073
23
4.1
22
72
13
62
54
3
0
41
1.16
6174061--6174134
37
2.0
37
85
12
100
68
4
5
21
1.26
6174056--6174107
18
2.9
18
74
5
52
67
1
3
26
1.18
6174150--6174178
15
1.9
15
100
0
58
75
0
13
10
1.04
6176922--6176962
21
2.0
21
85
0
55
46
31
7
14
1.72
6177004--6177048
7
6.4
7
86
0
63
48
26
0
24
1.51
6177084--6177187
55
1.9
55
84
4
138
46
26
3
23
1.69
6179114--6179164
11
4.8
10
80
7
57
39
21
7
31
1.82
6179114--6179167
21
2.5
22
82
14
76
38
20
9
31
1.84
6180768--6180805
14
2.7
14
84
12
51
55
26
2
15
1.54
6180768--6180812
13
3.3
14
82
11
58
53
26
2
17
1.56
6180768--6180832
27
2.4
27
81
2
67
53
24
1
20
1.54
6180976--6181031
21
2.7
22
81
8
64
53
23
0
23
1.46
6181147--6181209
14
4.4
14
80
7
56
46
22
0
31
1.52
6181273--6181325
21
2.6
21
80
14
58
47
30
3
18
1.67
6181398--6181451
7
7.9
7
73
19
51
42
31
0
25
1.55
6181393--6181451
21
2.8
21
85
10
77
44
32
0
23
1.54
6185129--6185243
27
4.3
26
85
5
140
36
22
23
17
1.95
6185129--6185243
54
2.1
54
85
3
160
36
22
23
17
1.95
6185344--6185395
26
2.0
26
88
7
79
30
21
17
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6185352--6185419
28
2.5
26
83
4
73
33
13
16
36
1.87
6186857--6186966
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
6188533--6188616
28
3.0
28
91
1
132
19
3
30
46
1.66
6188537--6188630
28
3.6
24
78
18
91
15
4
34
45
1.66
6194608--6194642
11
3.3
11
88
8
54
11
0
5
82
0.82
6197263--6197288
13
2.0
13
100
0
52
7
38
38
15
1.76
6201943--6201987
23
2.0
23
82
8
56
37
8
13
40
1.76
6206648--6206701
28
1.9
28
88
0
81
38
18
3
38
1.69
6206864--6206923
18
3.3
18
83
0
75
33
11
13
41
1.80
6208097--6208205
54
2.0
53
98
1
209
33
22
25
18
1.97
6208071--6208202
27
4.9
26
83
10
151
34
21
24
19
1.97
6209784--6209891
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
6216222--6216275
28
1.9
28
88
0
81
38
18
3
38
1.69
6216452--6216515
18
3.6
18
93
0
101
32
12
12
42
1.80
6216633--6216750
51
2.3
51
82
7
130
38
19
20
21
1.93
6217696--6217721
11
2.4
11
100
0
52
0
19
0
80
0.71
6217887--6217925
15
2.6
14
84
11
51
28
2
0
69
1.02
6217953--6217977
12
2.1
12
100
0
50
52
8
0
40
1.31
6220726--6220784
27
2.1
28
81
3
66
25
5
1
67
1.20
6220916--6220958
22
1.9
23
85
4
61
13
16
4
65
1.43
6237721--6237758
20
2.0
20
89
5
60
52
13
2
31
1.54
6242325--6242357
17
2.0
17
88
5
50
48
21
9
21
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6242591--6242621
15
2.1
15
100
0
62
35
6
6
51
1.53
6245815--6245857
23
1.9
22
81
13
52
62
6
0
30
1.21
6247575--6247627
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
6249107--6249199
32
2.9
32
96
0
177
38
23
5
32
1.78
6255624--6255676
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
6257160--6257252
32
2.9
32
93
0
159
43
21
4
31
1.72
6257167--6257271
32
3.3
31
80
10
115
42
20
4
32
1.72
6261665--6261752
23
3.9
22
75
14
81
25
21
17
36
1.94
6261643--6261766
44
2.7
46
79
9
137
24
22
17
35
1.95
6263985--6264087
51
2.0
52
98
1
199
33
9
5
50
1.59
6264054--6264416
181
2.0
181
97
0
690
44
11
13
30
1.79
6265240--6265273
17
1.9
17
88
5
50
79
0
11
8
0.94
6265221--6265281
6
10.3
6
76
3
52
78
1
9
9
1.03
6265230--6265281
12
4.4
12
80
4
61
78
0
11
9
0.95
6266982--6267006
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
6267154--6267185
15
2.1
16
88
11
50
53
6
40
0
1.26
6270893--6270938
11
4.4
11
86
8
51
80
8
0
10
0.91
6274520--6274553
16
2.1
16
89
10
52
64
8
5
20
1.43
6279470--6279497
13
2.2
13
100
0
56
35
7
7
50
1.57
6288202--6288249
24
2.0
24
100
0
96
33
8
20
37
1.83
6288839--6288922
39
2.1
40
93
2
143
23
15
20
40
1.90
6288941--6288985
21
2.1
21
84
8
56
28
26
13
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6289017--6289064
23
2.1
23
88
7
71
33
25
14
27
1.94
6289024--6289110
23
3.8
23
73
3
68
35
20
16
27
1.94
6289098--6289164
23
2.9
23
84
6
73
34
14
14
35
1.88
6289765--6289814
10
5.0
10
86
13
68
20
8
2
70
1.23
6306962--6307017
5
11.4
5
77
22
57
19
1
0
78
0.84
6306962--6307029
25
3.0
24
82
16
74
20
1
0
77
0.84
6306960--6307027
10
7.0
10
73
20
56
22
1
0
76
0.87
6307754--6307785
12
2.7
12
100
0
64
15
31
9
43
1.78
6308397--6308708
93
3.3
91
76
11
308
23
28
18
29
1.98
6308397--6308708
44
6.6
48
71
12
177
23
28
18
29
1.98
6311328--6311387
10
6.0
10
84
11
79
21
8
1
68
1.25
6316083--6316347
132
2.0
132
90
0
422
31
7
40
20
1.80
6315936--6316507
291
2.0
291
92
0
957
29
9
40
20
1.84
6316215--6316524
159
1.9
159
92
0
512
29
11
39
20
1.87
6316901--6316974
30
2.3
32
77
15
82
40
1
5
52
1.33
6317264--6317307
20
2.3
18
75
14
52
31
2
2
63
1.19
6318023--6318048
7
3.7
7
100
0
52
0
0
11
88
0.52
6320640--6320691
17
3.1
18
76
18
58
46
19
7
26
1.77
6322039--6322066
11
2.5
11
100
0
56
85
0
0
14
0.59
6322812--6322904
20
4.6
20
74
14
75
60
0
5
34
1.20
6323146--6323220
29
2.5
30
84
4
89
37
1
1
60
1.14
6330562--6330611
10
5.0
10
81
13
59
22
8
2
68
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6341935--6341994
10
6.0
10
78
7
59
23
8
3
65
1.36
6346325--6346376
14
3.9
14
76
14
56
34
1
0
63
1.06
6346497--6347236
87
8.7
86
82
6
679
33
12
9
44
1.75
6350162--6350205
20
2.2
20
84
8
54
34
4
11
50
1.59
6350641--6350695
18
3.1
18
80
10
69
34
0
0
65
0.93
6350629--6350687
32
1.9
30
89
6
91
38
0
0
61
0.96
6354470--6354517
25
1.9
25
86
0
69
35
22
14
27
1.93
6354561--6354619
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
6354565--6354619
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
6354670--6354812
24
6.0
24
88
4
191
29
21
21
27
1.99
6354670--6354812
47
3.0
47
86
5
189
29
21
21
27
1.99
6354670--6354813
71
2.0
72
89
4
220
29
21
21
27
1.99
6368002--6368047
20
2.3
21
82
14
62
26
17
28
28
1.98
6368136--6368188
28
1.9
28
84
3
72
28
18
26
26
1.98
6373462--6373507
20
2.3
21
82
14
62
26
17
28
28
1.98
6373596--6373648
28
1.9
28
84
3
72
28
18
26
26
1.98
6374564--6374796
3
75.0
3
75
14
147
60
5
3
31
1.34
6375273--6375308
11
3.2
12
88
11
58
47
0
52
0
1.00
6375403--6375445
12
3.6
12
100
0
86
13
0
6
79
0.93
6375403--6375453
24
2.2
23
92
3
84
13
0
7
78
0.96
6375411--6375462
23
2.2
24
82
3
61
23
0
5
71
1.07
6375829--6375897
35
2.0
35
94
0
120
21
10
49
18
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6381207--6381302
33
2.9
33
90
0
156
17
17
50
14
1.79
6386190--6386236
19
2.3
21
85
10
62
29
27
14
27
1.96
6386166--6386237
7
10.4
7
72
14
60
30
31
12
25
1.92
6387045--6387158
43
2.7
43
97
0
219
29
21
28
20
1.98
6387134--6387184
26
2.0
26
96
0
93
21
29
29
19
1.98
6387091--6387227
69
2.0
69
94
0
238
24
24
29
21
1.99
6387311--6387376
30
2.2
30
83
8
80
56
19
6
18
1.62
6387612--6387673
21
3.0
21
87
0
97
1
51
19
27
1.56
6388085--6388113
14
2.1
14
93
6
51
58
6
0
34
1.25
6388280--6388318
17
2.4
17
86
4
53
48
0
10
41
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410