Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5196406--5196455
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29
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52
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2
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2
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130
100
0
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21
24
25
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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13
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0
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18
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0
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1.95
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2.0
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2.0
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18
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2.9
18
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0
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18
2.8
18
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29
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1.94
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18
2.9
18
85
0
79
32
24
15
28
1.95
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0
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100
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4
16
28
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
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201
33
24
10
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1.90
5314036--5314204
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2.3
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216
33
24
11
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4.6
35
84
8
192
33
24
10
31
1.90
5321518--5321688
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2.4
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83
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217
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23
11
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1.98
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70
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1.98
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2
90
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4
0
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0
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1.65
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0
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19
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0
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43
100
0
174
27
16
13
42
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5375069--5375102
11
3.2
11
87
8
52
82
0
5
11
0.83
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196
2.0
195
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7
478
31
6
7
55
1.52
5381881--5381914
4
8.5
4
86
0
50
73
0
26
0
0.83
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47
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16
23
35
1.95
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47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
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161
2.0
161
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2.3
20
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2.7
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10
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5422397--5422568
75
2.4
75
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8
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31
11
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1.90
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2.0
36
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2.0
24
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0
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0
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0
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2.0
25
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0
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5
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37
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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25
2.0
25
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0
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5
17
37
1.74
5472626--5472673
12
3.9
12
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5
51
39
4
18
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1.70
5475482--5475525
12
3.7
12
100
0
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26
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0
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3.2
12
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2
0
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21
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73
46
0
1
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17
2.1
17
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0
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2
5
11
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5482977--5483041
13
5.3
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3
1
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5482976--5483041
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3.0
22
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9
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5483012--5483069
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20
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127
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0
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0.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410