Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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This is table  397  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120472864--120473039
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3.8
46
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10
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28
28
21
21
1.98
120479408--120479583
72
2.5
71
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2
203
29
14
21
34
1.93
120479583--120479748
72
2.3
71
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4
226
22
14
20
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5.5
140
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0
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24
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0
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13
2.5
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4
50
20
11
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1.59
120480159--120480428
127
2.1
128
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2
436
25
15
20
38
1.91
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201
2.5
201
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10
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15
19
33
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2.0
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17
18
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2.7
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258
31
17
17
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4.5
78
76
11
267
30
16
19
34
1.94
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246
3.3
241
82
8
845
29
16
19
34
1.94
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30
2.0
30
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6
84
18
8
30
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1.80
120481968--120482086
27
4.4
27
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4
125
17
23
21
36
1.94
120481978--120482086
54
2.0
54
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3
157
16
23
22
36
1.94
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3.8
46
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12
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20
21
29
28
1.98
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93
1.8
93
96
0
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20
21
29
27
1.98
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46
3.8
46
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12
216
20
21
29
28
1.98
120499876--120500047
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
120503815--120504109
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3.8
78
89
0
448
33
22
24
19
1.97
120505750--120505925
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120505747--120505918
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1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
120507554--120507590
18
2.1
18
89
0
56
24
51
5
18
1.67
120510988--120511020
14
2.4
14
90
10
50
39
0
3
57
1.14
120511528--120511557
15
2.0
15
93
0
51
23
0
16
60
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12
3.0
12
87
0
54
25
22
5
47
1.73
120520117--120520380
71
3.7
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83
6
323
25
14
22
37
1.92
120520259--120520505
122
2.0
124
89
3
383
24
13
22
39
1.90
120519950--120520542
263
2.3
257
94
2
1006
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14
22
37
1.92
120520380--120520820
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6.1
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10
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25
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21
36
1.94
120520610--120520821
74
2.9
74
83
4
259
26
17
23
31
1.97
120520811--120520845
14
2.5
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0
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17
20
5
57
1.60
120520826--120521518
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73
16
314
29
18
19
33
1.95
120520825--120521543
77
9.1
76
72
16
333
29
17
19
33
1.95
120520664--120521322
165
4.0
165
90
3
931
27
18
20
33
1.96
120521179--120521686
72
6.5
73
74
13
397
29
16
19
35
1.93
120521178--120521896
88
9.0
76
71
15
416
28
16
19
35
1.93
120521668--120521729
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
120521324--120521897
255
2.3
248
85
5
741
28
16
18
36
1.93
120522543--120522578
16
2.3
16
90
4
56
88
2
8
0
0.59
120522574--120522611
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2.3
17
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51
60
31
0
7
1.25
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11
89
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40
0
0
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0.97
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2.4
26
94
0
106
35
9
20
33
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120528939--120529225
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2.1
137
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493
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17
24
32
1.97
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13
2.3
13
100
0
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80
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0
13
0.91
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11
3.2
11
88
11
54
0
54
0
45
0.99
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3
77.0
3
75
14
159
31
2
5
60
1.34
120531361--120531392
14
2.1
16
88
11
50
28
6
0
65
1.16
120531538--120531609
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2.3
30
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13
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36
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2
55
1.38
120532756--120532840
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4.3
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32
1.40
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16
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17
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11
64
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2
21
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1.65
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117
42
2
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31
1.68
120533988--120534104
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2.0
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5
137
42
2
23
31
1.67
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1.9
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15
28
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15
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19
15
27
1.92
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359
25
15
24
33
1.95
120551863--120552173
141
2.2
145
83
6
402
27
16
25
31
1.96
120551863--120552167
72
4.3
71
78
7
273
27
16
24
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
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0
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120559487--120559515
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0
13
0
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29
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1
1
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1.13
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19
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30
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1.64
120564708--120564823
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0
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28
1.92
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120578686--120578726
16
2.5
17
80
11
59
17
4
12
65
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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20
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0
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38
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120609949--120610013
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1.98
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1.98
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2.6
42
88
5
154
23
37
24
14
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410