Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  258  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.12
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1.20
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3.3
50
92
0
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35
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23
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.94
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13
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1.94
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27
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26
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2.00
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2.00
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1.97
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1.96
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2.0
54
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152
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25
16
1.95
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2.3
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4.2
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100
0
216
35
26
7
30
1.84
79715616--79715774
27
5.9
27
83
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22
25
18
1.96
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54
2.7
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2
245
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24
17
1.96
79716648--79716807
26
6.2
26
93
0
266
36
25
6
31
1.81
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4.6
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22
25
25
2.00
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4.1
40
85
3
229
26
28
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.1
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1.98
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0
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1.79
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12
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56
2
1
38
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79821198--79821294
47
2.1
47
100
0
194
46
4
8
41
1.53
79821198--79821310
47
2.4
46
89
5
131
48
4
8
38
1.54
79821808--79821864
20
2.8
20
73
5
53
28
19
17
35
1.94
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40
5.5
40
88
1
287
23
23
27
25
2.00
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21
3.3
21
78
7
81
11
32
28
28
1.91
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43
2.4
43
83
3
125
13
34
26
25
1.93
79838121--79838179
19
3.3
19
65
26
56
42
8
6
42
1.61
79838113--79838178
34
1.9
34
100
0
132
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9
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1.64
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34
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34
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0
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10
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1.70
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73
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78
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170
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19
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108
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106
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15
19
25
1.92
79838418--79838831
35
11.5
36
76
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39
15
20
24
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32
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32
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42
13
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1.74
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32
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32
100
0
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17
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17
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0
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2
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48
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0
202
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1.60
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2.7
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20
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2.1
141
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1.97
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1.9
31
86
0
84
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13
15
43
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79857592--79857618
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12
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0
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0
0
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0.76
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2.7
29
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0
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1.96
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68
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30
2.0
30
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16
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0
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1.93
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1.99
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138
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23
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2.00
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0
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0
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2.0
26
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37
22
16
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79924690--79924742
26
2.0
26
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79929618--79929767
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2.0
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1
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1.67
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2.3
23
80
0
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14
27
22
35
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410