Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr13 124041150 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  410  ( 49152 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
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56
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26
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9
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2
1
23
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
2530824--2530896
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22
2.0
24
82
8
58
66
0
0
33
0.92
2534055--2534087
15
2.1
16
88
5
50
36
0
3
60
1.12
2536453--2536516
31
2.3
27
80
19
78
35
10
25
28
1.89
2536462--2536524
31
2.0
31
100
0
126
33
9
25
31
1.88
2538010--2538079
16
4.4
16
79
0
68
31
24
4
40
1.74
2539993--2540029
18
2.1
18
89
0
56
21
0
5
72
1.04
2543429--2543699
74
3.7
74
87
0
353
34
17
23
24
1.96
2543429--2543699
148
1.8
148
87
1
409
34
17
23
24
1.96
2545775--2545836
29
2.1
30
85
8
83
58
11
4
25
1.53
2546635--2546722
44
2.0
46
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4
126
35
22
5
36
1.78
2546709--2546748
16
2.5
16
91
0
71
27
25
7
40
1.82
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35
2.0
35
94
0
124
18
46
9
25
1.79
2550780--2550825
12
3.8
12
94
0
83
73
6
2
17
1.14
2551417--2551450
3
11.3
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100
0
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0
0
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0.91
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3
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0
50
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0
0
68
0.90
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32
2.2
31
80
14
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38
5
2
52
1.40
2552258--2552295
16
2.4
16
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4
51
34
10
2
52
1.50
2562103--2562134
2
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2
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0
64
0
50
0
50
1.00
2566472--2566506
16
2.1
17
89
5
54
34
2
5
57
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2566519--2566556
20
1.9
19
89
5
58
23
23
2
50
1.62
2567755--2567836
31
2.7
29
86
5
101
29
13
12
45
1.80
2567755--2567847
29
3.1
29
83
7
98
29
15
11
44
1.81
2570640--2570672
4
8.2
4
100
0
66
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0
24
0
0.80
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2.2
16
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5
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2
8
0
0.61
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17
2.3
17
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9
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59
32
0
8
1.27
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2
17.5
2
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0
61
48
2
0
48
1.16
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12
3.0
12
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0
54
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1.73
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1.9
71
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6
202
28
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22
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1.94
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2.5
14
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0
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20
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1.60
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2.8
90
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7
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28
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1.96
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7
325
31
16
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30
1.96
2581953--2582085
71
1.9
71
88
0
203
31
14
21
32
1.93
2581800--2582071
149
1.8
149
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7
361
32
17
21
28
1.96
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1.95
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165
2.9
167
85
4
612
28
17
19
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1.95
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2.2
74
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28
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1.95
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14
2.5
14
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0
61
17
17
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1.55
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14
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13
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30
13
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167
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165
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27
17
19
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30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
2582347--2582952
255
2.4
253
83
7
726
27
16
18
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2582786--2582941
88
1.8
83
81
8
122
30
19
19
31
1.96
2583598--2583631
15
2.3
15
90
5
52
88
2
8
0
0.62
2583627--2583662
16
2.3
16
95
4
65
61
33
0
5
1.19
2590449--2590490
21
1.9
23
85
9
61
54
2
0
42
1.13
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10
2.5
10
100
0
50
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0
0
32
0.90
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30
4.4
29
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1
0
42
1.09
2600401--2600446
3
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3
100
0
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0
0
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12
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68
1
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0
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18
2.9
18
91
0
88
11
20
22
45
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410