Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  329  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102153619--102153683
15
4.3
15
76
3
51
26
10
1
61
1.38
102154022--102154075
25
2.2
25
90
3
83
27
5
0
66
1.13
102154241--102154502
125
2.1
127
84
6
336
33
12
16
37
1.87
102154276--102154544
125
2.2
125
78
9
280
29
14
18
37
1.90
102155438--102155476
13
2.9
13
85
7
51
61
0
0
38
0.96
102161963--102161997
17
2.0
18
94
5
63
11
45
31
11
1.76
102166058--102166104
23
2.0
23
84
8
60
65
2
2
29
1.15
102169723--102169769
21
2.2
21
92
0
76
23
14
27
34
1.94
102175772--102175805
2
17.0
2
100
0
68
50
50
0
0
1.00
102175671--102176041
117
2.9
133
86
12
621
37
29
11
21
1.88
102181711--102181741
9
3.4
9
90
0
53
45
12
9
32
1.75
102181771--102181820
11
4.6
11
78
9
50
64
4
2
30
1.23
102183855--102183906
26
2.0
25
82
17
63
51
5
0
42
1.25
102184129--102184174
20
2.4
19
82
7
56
58
4
2
34
1.30
102191635--102191710
35
2.2
36
79
13
88
32
22
22
22
1.98
102191704--102191842
74
1.9
74
89
3
217
35
17
20
25
1.95
102191696--102191827
39
3.5
37
67
19
94
34
19
21
23
1.96
102191708--102191863
74
2.1
73
85
2
204
34
19
21
25
1.96
102192368--102192423
21
2.7
21
83
5
69
23
33
23
19
1.97
102193770--102193816
18
2.5
20
86
6
62
40
17
2
40
1.61
102197827--102197851
13
1.9
13
100
0
50
32
36
8
24
1.84
102198220--102198272
25
2.1
25
83
13
65
0
24
5
69
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102199556--102199588
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
102205236--102205265
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
102205870--102205932
30
2.1
30
93
0
108
25
3
14
57
1.52
102213733--102213767
18
1.9
18
88
0
52
62
0
0
37
0.95
102226008--102226046
20
2.0
19
85
5
51
48
5
0
46
1.24
102239827--102239865
20
2.0
19
85
5
51
48
5
0
46
1.24
102247902--102247939
2
19.0
2
94
0
67
47
0
2
50
1.15
102248181--102248219
13
3.0
13
84
0
60
43
2
17
35
1.63
102257456--102257502
23
2.0
23
100
0
94
27
8
17
46
1.76
102262169--102262214
5
9.0
5
80
4
56
63
0
34
2
1.07
102262597--102262640
6
7.3
6
89
0
61
15
31
20
31
1.94
102265449--102265619
66
2.6
66
79
5
175
36
10
26
26
1.89
102266567--102266595
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
102267313--102267431
42
2.8
42
80
9
152
31
25
13
29
1.94
102268747--102268908
86
1.9
86
84
5
220
37
10
23
28
1.88
102268973--102269143
87
2.0
87
88
2
254
38
15
21
24
1.92
102269125--102269165
21
2.0
21
90
0
64
36
2
26
34
1.70
102269039--102269255
108
2.0
108
83
1
274
37
12
22
27
1.91
102269147--102269491
87
4.0
86
81
6
313
37
12
22
27
1.90
102268973--102269342
195
1.9
195
81
4
451
38
13
22
26
1.91
102272458--102272532
15
5.5
13
71
22
55
37
4
1
57
1.26
102272474--102272519
21
2.2
21
84
7
58
34
6
0
58
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102272467--102272515
24
2.1
23
84
3
62
32
6
0
61
1.21
102283055--102283108
11
4.9
11
93
0
81
1
9
37
51
1.45
102284759--102284801
2
21.5
2
90
0
68
46
0
2
51
1.13
102285101--102285237
19
7.2
19
66
21
74
60
2
0
36
1.14
102285101--102285463
10
38.3
9
66
23
76
60
3
1
34
1.23
102285101--102285217
47
2.5
47
82
10
132
59
1
0
37
1.13
102285170--102285216
8
5.3
9
87
10
62
57
2
0
40
1.11
102285273--102285307
17
2.1
17
88
0
52
74
0
2
22
0.95
102285329--102285388
19
3.3
18
80
17
54
66
3
0
30
1.07
102285344--102285391
18
2.7
17
87
6
69
66
0
0
33
0.92
102285344--102285411
18
3.7
17
77
14
64
66
0
0
33
0.92
102285344--102285411
29
2.4
26
88
11
91
66
0
0
33
0.92
102285362--102285436
29
2.5
31
81
10
86
61
2
0
36
1.10
102285771--102285809
16
2.3
16
86
8
51
41
10
10
38
1.73
102286704--102286737
17
1.9
18
94
5
61
17
35
29
17
1.93
102288284--102288475
10
19.8
10
66
19
54
35
2
4
57
1.32
102288278--102288397
10
12.6
9
68
17
64
34
1
3
60
1.23
102288335--102288379
22
2.1
22
84
8
58
35
2
2
60
1.22
102288364--102288480
48
2.5
45
73
19
103
37
2
4
55
1.33
102290961--102290997
20
1.9
20
94
5
67
54
18
5
21
1.64
102302739--102302827
44
2.0
44
100
0
178
42
15
6
34
1.74
102305038--102305069
14
2.3
14
94
0
55
31
21
6
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102307782--102307811
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
102309689--102309738
2
25.0
2
87
0
73
50
6
0
44
1.26
102310981--102311006
11
2.4
11
100
0
52
34
0
0
65
0.93
102315772--102315859
44
2.0
44
100
0
176
34
11
22
31
1.90
102321397--102321434
3
12.7
3
100
0
76
34
65
0
0
0.93
102321433--102321484
3
17.3
3
100
0
104
32
34
0
32
1.58
102330565--102330599
17
2.2
17
90
10
56
74
0
0
25
0.82
102330563--102330599
15
2.2
18
81
18
53
72
0
0
27
0.84
102331758--102331798
15
2.7
15
85
10
57
41
4
0
53
1.22
102331758--102331797
16
2.7
15
88
7
55
42
2
0
55
1.13
102335616--102335798
40
4.7
39
84
9
239
24
22
27
25
2.00
102335616--102335796
78
2.3
79
85
7
244
24
22
27
25
2.00
102343794--102343976
40
4.7
39
84
9
239
24
22
27
25
2.00
102343794--102343974
78
2.3
79
85
7
244
24
22
27
25
2.00
102347355--102347417
28
2.2
28
97
2
117
20
23
6
49
1.72
102348495--102348536
19
2.4
17
78
17
50
59
0
9
30
1.29
102348501--102348539
19
2.1
18
90
4
60
58
0
7
33
1.26
102350209--102350242
17
1.9
17
88
5
50
38
20
8
32
1.84
102351494--102351552
28
2.1
28
96
0
109
27
25
15
32
1.95
102362049--102362074
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
102365079--102365209
29
4.5
29
88
0
163
29
15
31
23
1.95
102369217--102369301
43
2.0
43
97
0
161
30
10
20
38
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102370291--102370331
20
2.0
20
90
9
66
24
17
19
39
1.92
102372047--102372152
23
4.6
23
74
0
86
45
16
15
23
1.84
102372047--102372152
46
2.3
46
78
0
122
45
16
15
23
1.84
102372701--102372749
5
9.8
5
100
0
98
61
0
0
38
0.96
102373578--102373683
35
3.1
35
79
5
126
21
16
21
39
1.92
102376033--102376075
23
1.9
22
85
4
59
58
6
0
34
1.25
102384407--102384456
10
5.0
10
86
13
68
20
8
2
70
1.23
102389928--102390023
24
4.1
24
76
12
110
54
5
16
23
1.63
102392215--102392247
15
2.2
15
94
0
57
27
27
18
27
1.98
102393451--102393527
31
2.4
32
73
25
74
49
10
1
38
1.45
102397000--102397397
46
8.6
46
90
1
546
21
22
14
41
1.89
102397000--102397397
93
4.3
92
89
2
541
21
22
14
41
1.89
102405837--102405889
23
2.2
24
80
9
65
60
1
3
33
1.26
102406029--102406071
17
2.4
18
78
17
54
48
0
0
51
1.00
102409080--102409108
13
2.1
14
93
6
51
82
0
17
0
0.66
102409153--102409197
17
2.6
17
82
10
56
77
6
0
15
0.96
102410115--102410164
22
2.3
22
100
0
100
34
28
12
26
1.92
102416581--102416652
26
2.8
26
85
6
85
30
15
8
45
1.75
102421118--102421174
20
2.8
20
76
12
62
63
0
7
29
1.21
102421311--102421377
11
6.3
11
77
10
59
44
4
0
50
1.22
102421390--102421439
26
1.9
27
88
8
77
34
0
0
66
0.92
102421392--102421438
17
2.7
18
83
12
62
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102421405--102421453
19
2.7
18
81
12
55
40
0
0
59
0.98
102421539--102421646
32
3.4
32
90
1
173
31
12
14
40
1.84
102422804--102422836
17
2.0
17
88
5
50
33
15
3
48
1.60
102423122--102423394
92
3.0
92
90
0
402
20
24
14
40
1.90
102423122--102423394
46
5.9
46
89
0
359
20
24
14
40
1.90
102428267--102428299
17
2.0
17
88
5
50
33
15
3
48
1.60
102428583--102428898
46
6.9
46
89
1
395
20
23
13
41
1.89
102434117--102434296
90
2.0
90
90
0
279
24
26
20
28
1.99
102435026--102435070
23
2.0
22
82
4
54
40
26
4
28
1.75
102435317--102435354
15
2.5
15
100
0
76
26
26
5
42
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410