Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  354  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109293686--109293730
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0
0
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0
0
80
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0
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0
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0
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1.9
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1
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0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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109366353--109366400
19
2.5
20
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13
73
18
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2
70
1.22
109366354--109366383
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3.2
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0
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2.0
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2.2
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0
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66
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140
62
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12
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18
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455
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109404484--109404885
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519
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2
18
18
1.45
109404872--109404959
27
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25
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104
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2
18
18
1.45
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11
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52
0
15
31
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
53
0
15
31
1.42
109405364--109405449
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3.5
23
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20
75
52
0
15
32
1.43
109405363--109405524
47
3.2
48
83
9
184
53
0
15
30
1.42
109405438--109405508
28
2.5
27
75
11
70
52
0
16
30
1.45
109405493--109405550
21
3.0
18
82
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71
65
1
12
20
1.34
109405532--109405590
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2.6
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11
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1.40
109405582--109405619
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12
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16
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1.94
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17
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1.9
209
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1.9
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2
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0
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0
56
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7
7
42
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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18
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0
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2
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3
30
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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60
5
3
30
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410