Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  248  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76734755--76734821
33
2.0
33
94
0
116
29
22
22
25
1.99
76737414--76737650
49
4.9
49
90
3
367
29
30
7
32
1.85
76737578--76737724
73
2.0
74
98
1
287
29
31
8
30
1.86
76737627--76737675
25
2.0
24
96
4
89
28
32
8
30
1.86
76741387--76741667
40
7.1
40
96
0
501
25
27
22
24
2.00
76741721--76741795
38
2.0
38
81
5
89
24
24
18
33
1.97
76743959--76744196
49
4.9
49
91
3
376
28
30
7
32
1.85
76744172--76744221
25
2.0
25
100
0
100
28
32
8
32
1.86
76744123--76744270
74
2.0
74
100
0
296
29
31
8
31
1.86
76750706--76750751
24
1.9
24
86
0
65
28
26
17
28
1.98
76750792--76750830
10
3.8
10
93
6
69
33
17
17
30
1.94
76750791--76750830
21
1.9
21
100
0
80
35
17
17
30
1.93
76750877--76750946
25
2.8
25
91
0
113
25
24
22
27
2.00
76750876--76750959
25
3.4
24
82
8
98
28
21
22
27
1.99
76777447--76777497
18
2.9
18
94
2
86
21
31
35
11
1.90
76784312--76784545
87
2.7
87
80
1
263
38
17
21
23
1.93
76787124--76787311
40
4.6
41
86
6
224
34
26
14
25
1.94
76796235--76796313
25
3.3
25
66
16
67
31
30
5
32
1.79
76796185--76796505
49
6.7
49
91
2
474
29
30
8
31
1.87
76798268--76798399
46
2.9
43
78
13
124
29
28
18
22
1.98
76802630--76802789
41
3.9
42
79
8
143
30
26
15
28
1.96
76802633--76802818
40
4.6
40
78
5
151
30
26
16
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76804409--76804452
22
2.0
22
90
4
70
81
9
9
0
0.87
76807841--76808022
49
3.7
49
81
5
240
25
20
25
28
1.99
76811242--76811339
41
2.4
41
75
5
99
29
25
14
30
1.95
76817124--76817262
40
3.5
40
86
2
174
25
21
28
24
1.99
76825060--76825269
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
76830300--76830388
29
3.1
29
73
9
92
21
17
23
37
1.94
76831216--76831253
14
2.6
15
83
8
51
23
0
26
50
1.50
76840412--76840556
72
2.0
72
97
0
272
29
11
15
43
1.82
76841247--76841316
30
2.4
28
83
13
79
34
8
8
48
1.64
76843640--76843674
18
1.9
18
94
0
61
40
8
14
37
1.76
76849490--76849522
17
1.9
17
88
11
50
69
0
0
30
0.88
76849490--76849523
18
1.9
17
88
5
50
70
0
0
29
0.87
76849785--76849862
19
4.3
19
85
8
117
37
14
8
39
1.77
76849788--76849857
36
2.0
35
91
2
113
37
12
10
40
1.77
76849981--76850020
21
2.0
20
85
5
53
10
2
15
72
1.21
76850292--76850565
78
3.5
78
89
4
426
25
25
17
31
1.97
76852567--76852829
46
5.8
45
75
18
206
22
20
29
27
1.98
76852564--76852775
47
4.7
47
76
14
214
23
20
29
26
1.99
76852602--76852770
87
1.9
87
100
0
338
23
19
31
25
1.98
76862246--76862303
22
2.7
21
76
10
53
43
17
3
36
1.66
76862282--76862372
19
4.9
19
88
8
143
37
15
8
38
1.78
76862294--76862364
35
2.0
36
94
2
126
36
14
9
39
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76863505--76863586
29
2.9
27
85
9
92
31
0
3
64
1.11
76863505--76863559
8
7.2
8
83
8
71
30
0
1
67
1.01
76864276--76864310
15
2.4
14
90
9
61
48
28
0
22
1.51
76864334--76864378
14
3.2
14
80
0
54
48
26
0
24
1.51
76864472--76864592
7
17.0
7
71
12
59
42
36
1
19
1.62
76864472--76864514
22
2.0
22
86
9
61
41
34
0
23
1.55
76864909--76865015
41
2.7
41
83
9
132
29
17
22
29
1.97
76864995--76865079
39
2.2
40
89
2
127
24
20
18
36
1.95
76865318--76865391
34
2.2
33
78
2
85
29
12
18
39
1.87
76865326--76865389
34
1.9
34
87
3
94
32
14
14
39
1.85
76872347--76872390
20
2.2
20
87
0
61
45
22
11
20
1.83
76873174--76873217
22
2.0
22
95
0
79
25
13
34
27
1.93
76875962--76876015
23
2.3
22
81
12
63
57
7
20
14
1.61
76877376--76877455
40
2.0
41
82
7
101
6
18
3
71
1.23
76877476--76877529
5
10.8
5
100
0
108
61
0
0
38
0.96
76877539--76877586
19
2.5
19
86
6
62
35
6
4
54
1.45
76877539--76877590
18
2.7
19
88
5
70
34
7
3
53
1.48
76881366--76881419
10
5.6
10
73
8
58
64
0
1
33
1.04
76881355--76881418
11
6.4
11
72
20
59
67
1
1
29
1.09
76881355--76881421
20
3.4
20
76
17
77
65
1
1
31
1.10
76881357--76881456
38
2.7
37
78
12
107
64
1
3
32
1.16
76881355--76881455
10
10.4
10
70
19
54
65
0
2
30
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76881366--76881607
9
25.6
9
64
18
64
62
4
2
30
1.27
76881355--76881458
20
5.4
19
70
18
65
64
0
2
31
1.15
76881523--76881609
38
2.3
38
80
11
97
65
6
1
26
1.25
76883228--76883312
45
1.9
44
85
2
116
21
21
22
35
1.96
76887523--76887552
14
2.2
13
94
5
51
43
6
0
50
1.28
76890143--76890230
46
1.9
46
88
0
122
27
28
22
21
1.99
76893503--76893586
26
3.2
26
96
0
150
36
23
4
34
1.76
76897135--76897206
35
2.1
35
100
0
144
41
13
11
33
1.80
76899769--76899875
50
2.1
51
81
5
119
29
3
1
64
1.21
76899899--76899965
27
2.4
29
80
9
77
28
1
2
67
1.14
76899908--76899951
19
2.4
18
85
11
54
29
0
4
65
1.12
76899924--76899961
18
2.1
19
90
5
60
28
2
2
65
1.19
76899899--76900042
10
15.7
9
71
15
73
27
3
2
66
1.19
76900467--76900515
11
4.5
11
78
12
57
26
0
2
71
0.97
76900468--76900517
21
2.4
21
86
6
66
28
0
2
70
0.99
76900952--76900988
18
2.1
18
89
0
56
56
13
5
24
1.58
76904639--76904694
29
2.0
28
85
3
76
39
16
12
32
1.85
76906374--76906843
94
5.0
94
96
0
841
30
10
19
39
1.84
76906872--76906935
24
2.7
24
85
4
85
21
15
29
32
1.95
76908357--76908409
21
2.7
19
81
13
63
67
1
3
26
1.17
76908844--76908906
32
2.0
32
83
0
81
42
9
6
41
1.63
76908966--76909000
16
2.1
17
89
5
54
65
5
5
22
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76910078--76910169
34
2.7
34
79
3
114
45
16
5
32
1.70
76911557--76911583
13
2.1
13
100
0
54
29
0
22
48
1.51
76912525--76912551
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
76917530--76917579
25
2.0
25
84
0
64
38
6
14
42
1.70
76923143--76923192
19
2.6
19
74
22
52
70
4
0
26
1.05
76923143--76923200
9
6.3
9
77
18
57
70
5
0
24
1.07
76925573--76925704
29
4.6
29
84
1
149
25
16
32
25
1.96
76927092--76927149
29
2.0
29
100
0
116
24
27
27
20
1.99
76927316--76927360
24
1.9
23
95
0
72
33
17
13
35
1.89
76927562--76927592
15
2.0
16
93
6
55
29
0
0
70
0.87
76928862--76928906
23
2.0
23
95
0
81
17
26
13
42
1.86
76938552--76938609
26
2.4
25
86
11
84
43
8
13
34
1.75
76938560--76938611
26
2.0
26
100
0
104
46
7
15
30
1.74
76942197--76942329
58
2.3
57
84
5
169
44
1
3
51
1.26
76942493--76942547
16
3.4
16
80
5
67
29
25
5
40
1.78
76945391--76945521
50
2.6
51
86
2
192
32
13
13
39
1.84
76948447--76948664
40
5.5
40
91
2
334
24
23
27
24
2.00
76950837--76950930
50
2.0
46
81
12
109
35
30
1
32
1.65
76950929--76950985
3
18.0
3
92
7
87
33
31
0
35
1.58
76950928--76950991
9
6.5
11
87
10
54
31
29
1
37
1.67
76951381--76951414
14
2.4
14
100
0
68
64
0
5
29
1.17
76951377--76951414
14
2.7
15
95
4
62
63
0
5
31
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76958575--76959045
48
9.8
47
74
6
347
28
18
29
23
1.98
76958576--76959042
144
3.2
144
86
1
580
28
18
29
23
1.98
76961184--76961298
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
76961184--76961317
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
76963622--76963685
32
2.0
32
96
0
119
32
15
7
43
1.76
76966644--76966706
29
2.2
29
97
2
119
61
0
9
28
1.27
76967595--76967660
31
2.2
31
86
8
91
54
4
12
28
1.57
76967644--76967685
21
1.9
22
85
9
59
66
4
7
21
1.35
76969043--76969159
61
1.9
62
84
10
161
29
24
0
46
1.53
76969332--76969465
48
2.8
45
82
13
153
32
9
5
51
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410